Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S0

Usp44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, mousemouse

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp44Q8C2S0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp44Q8C2S0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp44Q8C2S0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp44Q8C2S0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp44Q8C2S0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp44Q8C2S0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp44Q8C2S0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Usp44Q8C2S0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp44Q8C2S0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Usp44Q8C2S0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Usp44Q8C2S0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp44Q8C2S0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Usp44Q8C2S0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp44Q8C2S0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp44Q8C2S0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp44Q8C2S0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp44Q8C2S0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp44Q8C2S0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp44Q8C2S0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp44Q8C2S0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp44Q8C2S0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp44Q8C2S0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp44Q8C2S0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp44Q8C2S0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp44Q8C2S0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp44Q8C2S0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp44Q8C2S0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp44Q8C2S0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp44Q8C2S0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp44Q8C2S0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp44Q8C2S0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp44Q8C2S0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp44Q8C2S0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp44Q8C2S0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp44Q8C2S0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp44Q8C2S0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp44Q8C2S0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp44Q8C2S0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp44Q8C2S0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp44Q8C2S0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp44Q8C2S0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp44Q8C2S0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Usp44Q8C2S0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Usp44Q8C2S0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Usp44Q8C2S0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp44Q8C2S0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp44Q8C2S0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp44Q8C2S0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp44Q8C2S0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp44Q8C2S0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp44Q8C2S0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp44Q8C2S0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp44Q8C2S0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp44Q8C2S0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp44Q8C2S0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp44Q8C2S0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp44Q8C2S0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp44Q8C2S0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp44Q8C2S0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp44Q8C2S0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp44Q8C2S0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp44Q8C2S0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp44Q8C2S0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp44Q8C2S0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp44Q8C2S0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp44Q8C2S0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp44Q8C2S0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp44Q8C2S0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp44Q8C2S0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp44Q8C2S0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp44Q8C2S0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp44Q8C2S0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp44Q8C2S0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp44Q8C2S0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp44Q8C2S0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp44Q8C2S0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp44Q8C2S0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
Usp44Q8C2S0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp44Q8C2S0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp44Q8C2S0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp44Q8C2S0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp44Q8C2S0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp44Q8C2S0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp44Q8C2S0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp44Q8C2S0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp44Q8C2S0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp44Q8C2S0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp44Q8C2S0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp44Q8C2S0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp44Q8C2S0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp44Q8C2S0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp44Q8C2S0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Usp44Q8C2S0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp44Q8C2S0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp44Q8C2S0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp44Q8C2S0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp44Q8C2S0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp44Q8C2S0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp44Q8C2S0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp44Q8C2S0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms