Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q8C1R3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q8C1R3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q8C1R3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q8C1R3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q8C1R3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q8C1R3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q8C1R3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q8C1R3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q8C1R3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q8C1R3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q8C1R3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q8C1R3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q8C1R3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q8C1R3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q8C1R3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q8C1R3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q8C1R3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q8C1R3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q8C1R3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q8C1R3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q8C1R3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q8C1R3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q8C1R3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q8C1R3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q8C1R3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q8C1R3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q8C1R3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q8C1R3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q8C1R3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q8C1R3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q8C1R3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q8C1R3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q8C1R3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q8C1R3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q8C1R3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q8C1R3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q8C1R3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q8C1R3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q8C1R3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q8C1R3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q8C1R3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q8C1R3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q8C1R3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q8C1R3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q8C1R3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Q8C1R3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q8C1R3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q8C1R3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q8C1R3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q8C1R3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q8C1R3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q8C1R3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q8C1R3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q8C1R3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Q8C1R3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q8C1R3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q8C1R3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q8C1R3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q8C1R3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q8C1R3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q8C1R3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q8C1R3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q8C1R3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q8C1R3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q8C1R3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q8C1R3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q8C1R3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q8C1R3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q8C1R3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q8C1R3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q8C1R3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q8C1R3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q8C1R3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q8C1R3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q8C1R3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Q8C1R3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q8C1R3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q8C1R3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q8C1R3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q8C1R3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q8C1R3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q8C1R3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q8C1R3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q8C1R3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q8C1R3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q8C1R3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q8C1R3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Q8C1R3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q8C1R3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q8C1R3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q8C1R3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q8C1R3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q8C1R3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Q8C1R3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q8C1R3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q8C1R3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q8C1R3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q8C1R3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q8C1R3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms