Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp37Q8C0R0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp37Q8C0R0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp37Q8C0R0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp37Q8C0R0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp37Q8C0R0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp37Q8C0R0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp37Q8C0R0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp37Q8C0R0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp37Q8C0R0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp37Q8C0R0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp37Q8C0R0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp37Q8C0R0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp37Q8C0R0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp37Q8C0R0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp37Q8C0R0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp37Q8C0R0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp37Q8C0R0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp37Q8C0R0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp37Q8C0R0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp37Q8C0R0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp37Q8C0R0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp37Q8C0R0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp37Q8C0R0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp37Q8C0R0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp37Q8C0R0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp37Q8C0R0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp37Q8C0R0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp37Q8C0R0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp37Q8C0R0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp37Q8C0R0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp37Q8C0R0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp37Q8C0R0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp37Q8C0R0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp37Q8C0R0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp37Q8C0R0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp37Q8C0R0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp37Q8C0R0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp37Q8C0R0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp37Q8C0R0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp37Q8C0R0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp37Q8C0R0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp37Q8C0R0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp37Q8C0R0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp37Q8C0R0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp37Q8C0R0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp37Q8C0R0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp37Q8C0R0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp37Q8C0R0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp37Q8C0R0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp37Q8C0R0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp37Q8C0R0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp37Q8C0R0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp37Q8C0R0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp37Q8C0R0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp37Q8C0R0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp37Q8C0R0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp37Q8C0R0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp37Q8C0R0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp37Q8C0R0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp37Q8C0R0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp37Q8C0R0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp37Q8C0R0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp37Q8C0R0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp37Q8C0R0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp37Q8C0R0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp37Q8C0R0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp37Q8C0R0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp37Q8C0R0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp37Q8C0R0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp37Q8C0R0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp37Q8C0R0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp37Q8C0R0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp37Q8C0R0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp37Q8C0R0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp37Q8C0R0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp37Q8C0R0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp37Q8C0R0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp37Q8C0R0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp37Q8C0R0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp37Q8C0R0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp37Q8C0R0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp37Q8C0R0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp37Q8C0R0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp37Q8C0R0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp37Q8C0R0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp37Q8C0R0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp37Q8C0R0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp37Q8C0R0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp37Q8C0R0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp37Q8C0R0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp37Q8C0R0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp37Q8C0R0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp37Q8C0R0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp37Q8C0R0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp37Q8C0R0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp37Q8C0R0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp37Q8C0R0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp37Q8C0R0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp37Q8C0R0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms