Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q9

Rapgef5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

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Length 814 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef5Q8C0Q9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rapgef5Q8C0Q9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rapgef5Q8C0Q9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rapgef5Q8C0Q9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rapgef5Q8C0Q9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rapgef5Q8C0Q9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rapgef5Q8C0Q9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rapgef5Q8C0Q9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rapgef5Q8C0Q9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rapgef5Q8C0Q9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rapgef5Q8C0Q9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rapgef5Q8C0Q9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rapgef5Q8C0Q9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rapgef5Q8C0Q9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Rapgef5Q8C0Q9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rapgef5Q8C0Q9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rapgef5Q8C0Q9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rapgef5Q8C0Q9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rapgef5Q8C0Q9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rapgef5Q8C0Q9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rapgef5Q8C0Q9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rapgef5Q8C0Q9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rapgef5Q8C0Q9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rapgef5Q8C0Q9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rapgef5Q8C0Q9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rapgef5Q8C0Q9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rapgef5Q8C0Q9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rapgef5Q8C0Q9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rapgef5Q8C0Q9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rapgef5Q8C0Q9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rapgef5Q8C0Q9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rapgef5Q8C0Q9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rapgef5Q8C0Q9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rapgef5Q8C0Q9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rapgef5Q8C0Q9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rapgef5Q8C0Q9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rapgef5Q8C0Q9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rapgef5Q8C0Q9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rapgef5Q8C0Q9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rapgef5Q8C0Q9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rapgef5Q8C0Q9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rapgef5Q8C0Q9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rapgef5Q8C0Q9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rapgef5Q8C0Q9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rapgef5Q8C0Q9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rapgef5Q8C0Q9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rapgef5Q8C0Q9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rapgef5Q8C0Q9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rapgef5Q8C0Q9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rapgef5Q8C0Q9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rapgef5Q8C0Q9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rapgef5Q8C0Q9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rapgef5Q8C0Q9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rapgef5Q8C0Q9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rapgef5Q8C0Q9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rapgef5Q8C0Q9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rapgef5Q8C0Q9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rapgef5Q8C0Q9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rapgef5Q8C0Q9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rapgef5Q8C0Q9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rapgef5Q8C0Q9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rapgef5Q8C0Q9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rapgef5Q8C0Q9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rapgef5Q8C0Q9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rapgef5Q8C0Q9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rapgef5Q8C0Q9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Rapgef5Q8C0Q9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rapgef5Q8C0Q9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rapgef5Q8C0Q9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rapgef5Q8C0Q9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rapgef5Q8C0Q9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rapgef5Q8C0Q9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rapgef5Q8C0Q9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rapgef5Q8C0Q9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rapgef5Q8C0Q9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rapgef5Q8C0Q9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rapgef5Q8C0Q9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rapgef5Q8C0Q9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rapgef5Q8C0Q9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rapgef5Q8C0Q9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rapgef5Q8C0Q9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Rapgef5Q8C0Q9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Rapgef5Q8C0Q9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rapgef5Q8C0Q9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rapgef5Q8C0Q9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rapgef5Q8C0Q9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rapgef5Q8C0Q9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rapgef5Q8C0Q9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rapgef5Q8C0Q9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rapgef5Q8C0Q9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rapgef5Q8C0Q9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rapgef5Q8C0Q9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rapgef5Q8C0Q9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rapgef5Q8C0Q9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rapgef5Q8C0Q9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rapgef5Q8C0Q9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rapgef5Q8C0Q9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rapgef5Q8C0Q9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rapgef5Q8C0Q9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
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