Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX90

Fndc3a, Fibronectin type-III domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3aQ8BX90 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fndc3aQ8BX90 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fndc3aQ8BX90 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fndc3aQ8BX90 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fndc3aQ8BX90 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fndc3aQ8BX90 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fndc3aQ8BX90 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Fndc3aQ8BX90 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fndc3aQ8BX90 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fndc3aQ8BX90 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fndc3aQ8BX90 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fndc3aQ8BX90 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fndc3aQ8BX90 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fndc3aQ8BX90 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fndc3aQ8BX90 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fndc3aQ8BX90 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fndc3aQ8BX90 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fndc3aQ8BX90 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Fndc3aQ8BX90 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fndc3aQ8BX90 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fndc3aQ8BX90 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fndc3aQ8BX90 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fndc3aQ8BX90 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fndc3aQ8BX90 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fndc3aQ8BX90 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fndc3aQ8BX90 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fndc3aQ8BX90 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fndc3aQ8BX90 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fndc3aQ8BX90 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fndc3aQ8BX90 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fndc3aQ8BX90 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Fndc3aQ8BX90 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Fndc3aQ8BX90 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fndc3aQ8BX90 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fndc3aQ8BX90 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Fndc3aQ8BX90 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Fndc3aQ8BX90 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fndc3aQ8BX90 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fndc3aQ8BX90 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fndc3aQ8BX90 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Fndc3aQ8BX90 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fndc3aQ8BX90 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fndc3aQ8BX90 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fndc3aQ8BX90 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fndc3aQ8BX90 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fndc3aQ8BX90 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fndc3aQ8BX90 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fndc3aQ8BX90 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fndc3aQ8BX90 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Fndc3aQ8BX90 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fndc3aQ8BX90 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fndc3aQ8BX90 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fndc3aQ8BX90 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fndc3aQ8BX90 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fndc3aQ8BX90 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Fndc3aQ8BX90 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fndc3aQ8BX90 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fndc3aQ8BX90 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fndc3aQ8BX90 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fndc3aQ8BX90 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fndc3aQ8BX90 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc3aQ8BX90 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc3aQ8BX90 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc3aQ8BX90 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc3aQ8BX90 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc3aQ8BX90 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fndc3aQ8BX90 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fndc3aQ8BX90 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fndc3aQ8BX90 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fndc3aQ8BX90 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fndc3aQ8BX90 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fndc3aQ8BX90 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fndc3aQ8BX90 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fndc3aQ8BX90 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fndc3aQ8BX90 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fndc3aQ8BX90 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fndc3aQ8BX90 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fndc3aQ8BX90 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fndc3aQ8BX90 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fndc3aQ8BX90 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fndc3aQ8BX90 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Fndc3aQ8BX90 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Fndc3aQ8BX90 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Fndc3aQ8BX90 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fndc3aQ8BX90 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fndc3aQ8BX90 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fndc3aQ8BX90 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fndc3aQ8BX90 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fndc3aQ8BX90 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Fndc3aQ8BX90 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fndc3aQ8BX90 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fndc3aQ8BX90 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fndc3aQ8BX90 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fndc3aQ8BX90 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fndc3aQ8BX90 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fndc3aQ8BX90 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fndc3aQ8BX90 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fndc3aQ8BX90 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fndc3aQ8BX90 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fndc3aQ8BX90 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms