Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp398Q8BV16 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp398Q8BV16 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp398Q8BV16 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp398Q8BV16 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp398Q8BV16 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp398Q8BV16 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp398Q8BV16 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp398Q8BV16 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp398Q8BV16 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp398Q8BV16 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp398Q8BV16 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp398Q8BV16 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp398Q8BV16 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp398Q8BV16 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp398Q8BV16 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp398Q8BV16 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp398Q8BV16 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp398Q8BV16 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp398Q8BV16 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp398Q8BV16 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp398Q8BV16 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp398Q8BV16 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp398Q8BV16 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp398Q8BV16 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp398Q8BV16 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp398Q8BV16 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp398Q8BV16 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp398Q8BV16 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp398Q8BV16 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp398Q8BV16 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp398Q8BV16 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp398Q8BV16 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp398Q8BV16 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp398Q8BV16 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp398Q8BV16 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp398Q8BV16 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp398Q8BV16 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp398Q8BV16 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp398Q8BV16 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp398Q8BV16 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp398Q8BV16 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zfp398Q8BV16 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zfp398Q8BV16 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp398Q8BV16 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp398Q8BV16 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp398Q8BV16 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp398Q8BV16 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp398Q8BV16 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp398Q8BV16 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp398Q8BV16 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp398Q8BV16 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp398Q8BV16 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp398Q8BV16 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp398Q8BV16 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp398Q8BV16 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp398Q8BV16 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp398Q8BV16 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp398Q8BV16 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp398Q8BV16 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp398Q8BV16 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp398Q8BV16 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp398Q8BV16 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp398Q8BV16 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp398Q8BV16 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfp398Q8BV16 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfp398Q8BV16 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp398Q8BV16 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp398Q8BV16 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp398Q8BV16 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp398Q8BV16 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp398Q8BV16 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp398Q8BV16 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp398Q8BV16 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp398Q8BV16 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp398Q8BV16 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp398Q8BV16 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp398Q8BV16 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp398Q8BV16 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp398Q8BV16 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp398Q8BV16 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp398Q8BV16 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp398Q8BV16 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp398Q8BV16 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp398Q8BV16 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp398Q8BV16 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp398Q8BV16 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp398Q8BV16 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp398Q8BV16 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp398Q8BV16 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp398Q8BV16 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp398Q8BV16 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp398Q8BV16 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp398Q8BV16 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp398Q8BV16 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp398Q8BV16 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp398Q8BV16 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp398Q8BV16 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp398Q8BV16 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp398Q8BV16 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.7 ms