Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmem260Q8BMD6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmem260Q8BMD6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmem260Q8BMD6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmem260Q8BMD6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmem260Q8BMD6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmem260Q8BMD6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmem260Q8BMD6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmem260Q8BMD6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmem260Q8BMD6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem260Q8BMD6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmem260Q8BMD6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmem260Q8BMD6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmem260Q8BMD6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmem260Q8BMD6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmem260Q8BMD6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmem260Q8BMD6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem260Q8BMD6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem260Q8BMD6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem260Q8BMD6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem260Q8BMD6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmem260Q8BMD6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmem260Q8BMD6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmem260Q8BMD6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmem260Q8BMD6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmem260Q8BMD6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmem260Q8BMD6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tmem260Q8BMD6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmem260Q8BMD6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmem260Q8BMD6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem260Q8BMD6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem260Q8BMD6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem260Q8BMD6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem260Q8BMD6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmem260Q8BMD6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmem260Q8BMD6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmem260Q8BMD6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmem260Q8BMD6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmem260Q8BMD6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmem260Q8BMD6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmem260Q8BMD6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmem260Q8BMD6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmem260Q8BMD6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmem260Q8BMD6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmem260Q8BMD6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmem260Q8BMD6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmem260Q8BMD6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmem260Q8BMD6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmem260Q8BMD6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tmem260Q8BMD6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tmem260Q8BMD6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmem260Q8BMD6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmem260Q8BMD6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmem260Q8BMD6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmem260Q8BMD6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmem260Q8BMD6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmem260Q8BMD6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmem260Q8BMD6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmem260Q8BMD6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmem260Q8BMD6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmem260Q8BMD6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tmem260Q8BMD6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmem260Q8BMD6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmem260Q8BMD6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmem260Q8BMD6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmem260Q8BMD6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmem260Q8BMD6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmem260Q8BMD6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmem260Q8BMD6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmem260Q8BMD6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmem260Q8BMD6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmem260Q8BMD6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmem260Q8BMD6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmem260Q8BMD6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmem260Q8BMD6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmem260Q8BMD6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmem260Q8BMD6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmem260Q8BMD6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmem260Q8BMD6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tmem260Q8BMD6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tmem260Q8BMD6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmem260Q8BMD6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmem260Q8BMD6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmem260Q8BMD6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmem260Q8BMD6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmem260Q8BMD6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmem260Q8BMD6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmem260Q8BMD6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmem260Q8BMD6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem260Q8BMD6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem260Q8BMD6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem260Q8BMD6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem260Q8BMD6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem260Q8BMD6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem260Q8BMD6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem260Q8BMD6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem260Q8BMD6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmem260Q8BMD6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmem260Q8BMD6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmem260Q8BMD6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms