Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJX2

6820408C15Rik, RIKEN cDNA 6820408C15, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6820408C15RikQ8BJX2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
6820408C15RikQ8BJX2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
6820408C15RikQ8BJX2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
6820408C15RikQ8BJX2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
6820408C15RikQ8BJX2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
6820408C15RikQ8BJX2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
6820408C15RikQ8BJX2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
6820408C15RikQ8BJX2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
6820408C15RikQ8BJX2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
6820408C15RikQ8BJX2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
6820408C15RikQ8BJX2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
6820408C15RikQ8BJX2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
6820408C15RikQ8BJX2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
6820408C15RikQ8BJX2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
6820408C15RikQ8BJX2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
6820408C15RikQ8BJX2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
6820408C15RikQ8BJX2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
6820408C15RikQ8BJX2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
6820408C15RikQ8BJX2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
6820408C15RikQ8BJX2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
6820408C15RikQ8BJX2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
6820408C15RikQ8BJX2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
6820408C15RikQ8BJX2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
6820408C15RikQ8BJX2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
6820408C15RikQ8BJX2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
6820408C15RikQ8BJX2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
6820408C15RikQ8BJX2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
6820408C15RikQ8BJX2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
6820408C15RikQ8BJX2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
6820408C15RikQ8BJX2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
6820408C15RikQ8BJX2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
6820408C15RikQ8BJX2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
6820408C15RikQ8BJX2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
6820408C15RikQ8BJX2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
6820408C15RikQ8BJX2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
6820408C15RikQ8BJX2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
6820408C15RikQ8BJX2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
6820408C15RikQ8BJX2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
6820408C15RikQ8BJX2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
6820408C15RikQ8BJX2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
6820408C15RikQ8BJX2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
6820408C15RikQ8BJX2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
6820408C15RikQ8BJX2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
6820408C15RikQ8BJX2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
6820408C15RikQ8BJX2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
6820408C15RikQ8BJX2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
6820408C15RikQ8BJX2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
6820408C15RikQ8BJX2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
6820408C15RikQ8BJX2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
6820408C15RikQ8BJX2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
6820408C15RikQ8BJX2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
6820408C15RikQ8BJX2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
6820408C15RikQ8BJX2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
6820408C15RikQ8BJX2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
6820408C15RikQ8BJX2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
6820408C15RikQ8BJX2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
6820408C15RikQ8BJX2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
6820408C15RikQ8BJX2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
6820408C15RikQ8BJX2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
6820408C15RikQ8BJX2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
6820408C15RikQ8BJX2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
6820408C15RikQ8BJX2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
6820408C15RikQ8BJX2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
6820408C15RikQ8BJX2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
6820408C15RikQ8BJX2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
6820408C15RikQ8BJX2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
6820408C15RikQ8BJX2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
6820408C15RikQ8BJX2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
6820408C15RikQ8BJX2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
6820408C15RikQ8BJX2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
6820408C15RikQ8BJX2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
6820408C15RikQ8BJX2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
6820408C15RikQ8BJX2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
6820408C15RikQ8BJX2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
6820408C15RikQ8BJX2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
6820408C15RikQ8BJX2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
6820408C15RikQ8BJX2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
6820408C15RikQ8BJX2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
6820408C15RikQ8BJX2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
6820408C15RikQ8BJX2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
6820408C15RikQ8BJX2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
6820408C15RikQ8BJX2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
6820408C15RikQ8BJX2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
6820408C15RikQ8BJX2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
6820408C15RikQ8BJX2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
6820408C15RikQ8BJX2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
6820408C15RikQ8BJX2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
6820408C15RikQ8BJX2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
6820408C15RikQ8BJX2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
6820408C15RikQ8BJX2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
6820408C15RikQ8BJX2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
6820408C15RikQ8BJX2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
6820408C15RikQ8BJX2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
6820408C15RikQ8BJX2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
6820408C15RikQ8BJX2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
6820408C15RikQ8BJX2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
6820408C15RikQ8BJX2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
6820408C15RikQ8BJX2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
6820408C15RikQ8BJX2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
6820408C15RikQ8BJX2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms