Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp1Q8BJQ2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp1Q8BJQ2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp1Q8BJQ2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp1Q8BJQ2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp1Q8BJQ2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp1Q8BJQ2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp1Q8BJQ2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp1Q8BJQ2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp1Q8BJQ2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp1Q8BJQ2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp1Q8BJQ2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp1Q8BJQ2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp1Q8BJQ2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp1Q8BJQ2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp1Q8BJQ2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp1Q8BJQ2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp1Q8BJQ2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp1Q8BJQ2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp1Q8BJQ2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp1Q8BJQ2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp1Q8BJQ2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp1Q8BJQ2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp1Q8BJQ2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp1Q8BJQ2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp1Q8BJQ2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp1Q8BJQ2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp1Q8BJQ2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp1Q8BJQ2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp1Q8BJQ2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp1Q8BJQ2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp1Q8BJQ2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp1Q8BJQ2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp1Q8BJQ2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp1Q8BJQ2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp1Q8BJQ2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp1Q8BJQ2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp1Q8BJQ2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp1Q8BJQ2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp1Q8BJQ2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp1Q8BJQ2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp1Q8BJQ2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp1Q8BJQ2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp1Q8BJQ2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp1Q8BJQ2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp1Q8BJQ2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp1Q8BJQ2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp1Q8BJQ2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp1Q8BJQ2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp1Q8BJQ2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp1Q8BJQ2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp1Q8BJQ2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp1Q8BJQ2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp1Q8BJQ2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp1Q8BJQ2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp1Q8BJQ2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp1Q8BJQ2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp1Q8BJQ2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp1Q8BJQ2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp1Q8BJQ2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp1Q8BJQ2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp1Q8BJQ2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp1Q8BJQ2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp1Q8BJQ2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp1Q8BJQ2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp1Q8BJQ2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp1Q8BJQ2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp1Q8BJQ2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp1Q8BJQ2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp1Q8BJQ2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp1Q8BJQ2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp1Q8BJQ2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp1Q8BJQ2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp1Q8BJQ2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp1Q8BJQ2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp1Q8BJQ2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp1Q8BJQ2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp1Q8BJQ2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp1Q8BJQ2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp1Q8BJQ2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp1Q8BJQ2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp1Q8BJQ2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp1Q8BJQ2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp1Q8BJQ2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp1Q8BJQ2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp1Q8BJQ2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp1Q8BJQ2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp1Q8BJQ2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp1Q8BJQ2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp1Q8BJQ2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp1Q8BJQ2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp1Q8BJQ2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp1Q8BJQ2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp1Q8BJQ2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp1Q8BJQ2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp1Q8BJQ2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp1Q8BJQ2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp1Q8BJQ2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp1Q8BJQ2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp1Q8BJQ2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
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