Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII1

Prox2, Prospero homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox2Q8BII1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prox2Q8BII1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prox2Q8BII1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prox2Q8BII1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prox2Q8BII1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prox2Q8BII1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prox2Q8BII1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Prox2Q8BII1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prox2Q8BII1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prox2Q8BII1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prox2Q8BII1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prox2Q8BII1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prox2Q8BII1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prox2Q8BII1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prox2Q8BII1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prox2Q8BII1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prox2Q8BII1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prox2Q8BII1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prox2Q8BII1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prox2Q8BII1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prox2Q8BII1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prox2Q8BII1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prox2Q8BII1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prox2Q8BII1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Prox2Q8BII1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prox2Q8BII1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Prox2Q8BII1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prox2Q8BII1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prox2Q8BII1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prox2Q8BII1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prox2Q8BII1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prox2Q8BII1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Prox2Q8BII1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prox2Q8BII1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prox2Q8BII1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prox2Q8BII1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prox2Q8BII1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prox2Q8BII1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prox2Q8BII1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prox2Q8BII1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prox2Q8BII1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prox2Q8BII1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prox2Q8BII1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prox2Q8BII1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prox2Q8BII1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prox2Q8BII1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prox2Q8BII1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prox2Q8BII1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Prox2Q8BII1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prox2Q8BII1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prox2Q8BII1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prox2Q8BII1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prox2Q8BII1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prox2Q8BII1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prox2Q8BII1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prox2Q8BII1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prox2Q8BII1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prox2Q8BII1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prox2Q8BII1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prox2Q8BII1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prox2Q8BII1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prox2Q8BII1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prox2Q8BII1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prox2Q8BII1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prox2Q8BII1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prox2Q8BII1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prox2Q8BII1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prox2Q8BII1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prox2Q8BII1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prox2Q8BII1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prox2Q8BII1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prox2Q8BII1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prox2Q8BII1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prox2Q8BII1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prox2Q8BII1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prox2Q8BII1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prox2Q8BII1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prox2Q8BII1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prox2Q8BII1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prox2Q8BII1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prox2Q8BII1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prox2Q8BII1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prox2Q8BII1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prox2Q8BII1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prox2Q8BII1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prox2Q8BII1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Prox2Q8BII1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prox2Q8BII1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prox2Q8BII1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prox2Q8BII1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prox2Q8BII1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prox2Q8BII1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prox2Q8BII1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prox2Q8BII1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prox2Q8BII1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prox2Q8BII1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prox2Q8BII1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prox2Q8BII1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prox2Q8BII1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prox2Q8BII1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms