Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH02

Tor4a, Torsin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor4aQ8BH02 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tor4aQ8BH02 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tor4aQ8BH02 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tor4aQ8BH02 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tor4aQ8BH02 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tor4aQ8BH02 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tor4aQ8BH02 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tor4aQ8BH02 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tor4aQ8BH02 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tor4aQ8BH02 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tor4aQ8BH02 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tor4aQ8BH02 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tor4aQ8BH02 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tor4aQ8BH02 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tor4aQ8BH02 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tor4aQ8BH02 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tor4aQ8BH02 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tor4aQ8BH02 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tor4aQ8BH02 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tor4aQ8BH02 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tor4aQ8BH02 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tor4aQ8BH02 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tor4aQ8BH02 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tor4aQ8BH02 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tor4aQ8BH02 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tor4aQ8BH02 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tor4aQ8BH02 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tor4aQ8BH02 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tor4aQ8BH02 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tor4aQ8BH02 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tor4aQ8BH02 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tor4aQ8BH02 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tor4aQ8BH02 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tor4aQ8BH02 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tor4aQ8BH02 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tor4aQ8BH02 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tor4aQ8BH02 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Tor4aQ8BH02 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tor4aQ8BH02 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tor4aQ8BH02 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tor4aQ8BH02 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tor4aQ8BH02 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tor4aQ8BH02 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tor4aQ8BH02 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tor4aQ8BH02 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tor4aQ8BH02 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tor4aQ8BH02 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tor4aQ8BH02 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tor4aQ8BH02 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tor4aQ8BH02 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tor4aQ8BH02 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tor4aQ8BH02 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tor4aQ8BH02 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tor4aQ8BH02 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tor4aQ8BH02 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tor4aQ8BH02 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tor4aQ8BH02 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tor4aQ8BH02 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Tor4aQ8BH02 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tor4aQ8BH02 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tor4aQ8BH02 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tor4aQ8BH02 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tor4aQ8BH02 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tor4aQ8BH02 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tor4aQ8BH02 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tor4aQ8BH02 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tor4aQ8BH02 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tor4aQ8BH02 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tor4aQ8BH02 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tor4aQ8BH02 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tor4aQ8BH02 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tor4aQ8BH02 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tor4aQ8BH02 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tor4aQ8BH02 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tor4aQ8BH02 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tor4aQ8BH02 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tor4aQ8BH02 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Tor4aQ8BH02 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tor4aQ8BH02 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tor4aQ8BH02 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tor4aQ8BH02 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tor4aQ8BH02 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tor4aQ8BH02 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tor4aQ8BH02 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tor4aQ8BH02 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tor4aQ8BH02 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tor4aQ8BH02 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tor4aQ8BH02 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tor4aQ8BH02 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tor4aQ8BH02 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tor4aQ8BH02 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tor4aQ8BH02 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tor4aQ8BH02 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tor4aQ8BH02 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tor4aQ8BH02 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tor4aQ8BH02 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tor4aQ8BH02 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tor4aQ8BH02 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tor4aQ8BH02 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tor4aQ8BH02 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms