Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGN2

D3Ertd751e, UPF0462 protein C4orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D3Ertd751eQ8BGN2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
D3Ertd751eQ8BGN2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
D3Ertd751eQ8BGN2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
D3Ertd751eQ8BGN2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
D3Ertd751eQ8BGN2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
D3Ertd751eQ8BGN2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
D3Ertd751eQ8BGN2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
D3Ertd751eQ8BGN2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
D3Ertd751eQ8BGN2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
D3Ertd751eQ8BGN2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
D3Ertd751eQ8BGN2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
D3Ertd751eQ8BGN2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
D3Ertd751eQ8BGN2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
D3Ertd751eQ8BGN2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
D3Ertd751eQ8BGN2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
D3Ertd751eQ8BGN2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
D3Ertd751eQ8BGN2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
D3Ertd751eQ8BGN2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
D3Ertd751eQ8BGN2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
D3Ertd751eQ8BGN2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
D3Ertd751eQ8BGN2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
D3Ertd751eQ8BGN2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
D3Ertd751eQ8BGN2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
D3Ertd751eQ8BGN2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
D3Ertd751eQ8BGN2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
D3Ertd751eQ8BGN2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
D3Ertd751eQ8BGN2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
D3Ertd751eQ8BGN2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
D3Ertd751eQ8BGN2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
D3Ertd751eQ8BGN2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
D3Ertd751eQ8BGN2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
D3Ertd751eQ8BGN2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
D3Ertd751eQ8BGN2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
D3Ertd751eQ8BGN2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
D3Ertd751eQ8BGN2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
D3Ertd751eQ8BGN2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
D3Ertd751eQ8BGN2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
D3Ertd751eQ8BGN2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
D3Ertd751eQ8BGN2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
D3Ertd751eQ8BGN2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
D3Ertd751eQ8BGN2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
D3Ertd751eQ8BGN2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
D3Ertd751eQ8BGN2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
D3Ertd751eQ8BGN2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
D3Ertd751eQ8BGN2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
D3Ertd751eQ8BGN2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
D3Ertd751eQ8BGN2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
D3Ertd751eQ8BGN2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
D3Ertd751eQ8BGN2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
D3Ertd751eQ8BGN2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
D3Ertd751eQ8BGN2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
D3Ertd751eQ8BGN2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
D3Ertd751eQ8BGN2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
D3Ertd751eQ8BGN2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
D3Ertd751eQ8BGN2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
D3Ertd751eQ8BGN2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
D3Ertd751eQ8BGN2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
D3Ertd751eQ8BGN2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
D3Ertd751eQ8BGN2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
D3Ertd751eQ8BGN2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
D3Ertd751eQ8BGN2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
D3Ertd751eQ8BGN2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
D3Ertd751eQ8BGN2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
D3Ertd751eQ8BGN2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
D3Ertd751eQ8BGN2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
D3Ertd751eQ8BGN2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
D3Ertd751eQ8BGN2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
D3Ertd751eQ8BGN2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
D3Ertd751eQ8BGN2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
D3Ertd751eQ8BGN2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
D3Ertd751eQ8BGN2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
D3Ertd751eQ8BGN2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
D3Ertd751eQ8BGN2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
D3Ertd751eQ8BGN2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
D3Ertd751eQ8BGN2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
D3Ertd751eQ8BGN2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
D3Ertd751eQ8BGN2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
D3Ertd751eQ8BGN2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
D3Ertd751eQ8BGN2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
D3Ertd751eQ8BGN2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
D3Ertd751eQ8BGN2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
D3Ertd751eQ8BGN2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
D3Ertd751eQ8BGN2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
D3Ertd751eQ8BGN2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
D3Ertd751eQ8BGN2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
D3Ertd751eQ8BGN2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
D3Ertd751eQ8BGN2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
D3Ertd751eQ8BGN2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
D3Ertd751eQ8BGN2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
D3Ertd751eQ8BGN2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
D3Ertd751eQ8BGN2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
D3Ertd751eQ8BGN2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
D3Ertd751eQ8BGN2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
D3Ertd751eQ8BGN2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
D3Ertd751eQ8BGN2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
D3Ertd751eQ8BGN2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
D3Ertd751eQ8BGN2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
D3Ertd751eQ8BGN2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
D3Ertd751eQ8BGN2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
D3Ertd751eQ8BGN2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms