Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrfn4Q80XU8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrfn4Q80XU8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrfn4Q80XU8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrfn4Q80XU8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrfn4Q80XU8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrfn4Q80XU8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrfn4Q80XU8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrfn4Q80XU8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrfn4Q80XU8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrfn4Q80XU8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrfn4Q80XU8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrfn4Q80XU8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrfn4Q80XU8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrfn4Q80XU8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrfn4Q80XU8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrfn4Q80XU8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrfn4Q80XU8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrfn4Q80XU8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrfn4Q80XU8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrfn4Q80XU8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrfn4Q80XU8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrfn4Q80XU8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrfn4Q80XU8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrfn4Q80XU8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrfn4Q80XU8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrfn4Q80XU8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrfn4Q80XU8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrfn4Q80XU8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrfn4Q80XU8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrfn4Q80XU8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrfn4Q80XU8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrfn4Q80XU8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrfn4Q80XU8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrfn4Q80XU8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrfn4Q80XU8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrfn4Q80XU8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrfn4Q80XU8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrfn4Q80XU8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrfn4Q80XU8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lrfn4Q80XU8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lrfn4Q80XU8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrfn4Q80XU8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrfn4Q80XU8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrfn4Q80XU8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrfn4Q80XU8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrfn4Q80XU8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrfn4Q80XU8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrfn4Q80XU8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrfn4Q80XU8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrfn4Q80XU8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrfn4Q80XU8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrfn4Q80XU8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrfn4Q80XU8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrfn4Q80XU8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrfn4Q80XU8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrfn4Q80XU8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrfn4Q80XU8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrfn4Q80XU8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrfn4Q80XU8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrfn4Q80XU8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrfn4Q80XU8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrfn4Q80XU8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrfn4Q80XU8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrfn4Q80XU8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrfn4Q80XU8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrfn4Q80XU8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrfn4Q80XU8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrfn4Q80XU8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrfn4Q80XU8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrfn4Q80XU8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrfn4Q80XU8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrfn4Q80XU8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrfn4Q80XU8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrfn4Q80XU8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrfn4Q80XU8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrfn4Q80XU8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrfn4Q80XU8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrfn4Q80XU8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrfn4Q80XU8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrfn4Q80XU8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrfn4Q80XU8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrfn4Q80XU8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrfn4Q80XU8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrfn4Q80XU8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrfn4Q80XU8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrfn4Q80XU8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrfn4Q80XU8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrfn4Q80XU8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrfn4Q80XU8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrfn4Q80XU8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrfn4Q80XU8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrfn4Q80XU8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrfn4Q80XU8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrfn4Q80XU8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrfn4Q80XU8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrfn4Q80XU8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrfn4Q80XU8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrfn4Q80XU8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrfn4Q80XU8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 199.7 ms