Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pja2Q80U04 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pja2Q80U04 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pja2Q80U04 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pja2Q80U04 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pja2Q80U04 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pja2Q80U04 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pja2Q80U04 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pja2Q80U04 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pja2Q80U04 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pja2Q80U04 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pja2Q80U04 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pja2Q80U04 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pja2Q80U04 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pja2Q80U04 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pja2Q80U04 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pja2Q80U04 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pja2Q80U04 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pja2Q80U04 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pja2Q80U04 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pja2Q80U04 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pja2Q80U04 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pja2Q80U04 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pja2Q80U04 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pja2Q80U04 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pja2Q80U04 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pja2Q80U04 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pja2Q80U04 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pja2Q80U04 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pja2Q80U04 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pja2Q80U04 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pja2Q80U04 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pja2Q80U04 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pja2Q80U04 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pja2Q80U04 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pja2Q80U04 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pja2Q80U04 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pja2Q80U04 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pja2Q80U04 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pja2Q80U04 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pja2Q80U04 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pja2Q80U04 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pja2Q80U04 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pja2Q80U04 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pja2Q80U04 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pja2Q80U04 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pja2Q80U04 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pja2Q80U04 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pja2Q80U04 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pja2Q80U04 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pja2Q80U04 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pja2Q80U04 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pja2Q80U04 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pja2Q80U04 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pja2Q80U04 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pja2Q80U04 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pja2Q80U04 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pja2Q80U04 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pja2Q80U04 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pja2Q80U04 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pja2Q80U04 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pja2Q80U04 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pja2Q80U04 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pja2Q80U04 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pja2Q80U04 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pja2Q80U04 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pja2Q80U04 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pja2Q80U04 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pja2Q80U04 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pja2Q80U04 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pja2Q80U04 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pja2Q80U04 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pja2Q80U04 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pja2Q80U04 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pja2Q80U04 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pja2Q80U04 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pja2Q80U04 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pja2Q80U04 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pja2Q80U04 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pja2Q80U04 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pja2Q80U04 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pja2Q80U04 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pja2Q80U04 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pja2Q80U04 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Pja2Q80U04 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pja2Q80U04 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pja2Q80U04 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pja2Q80U04 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pja2Q80U04 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pja2Q80U04 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pja2Q80U04 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pja2Q80U04 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pja2Q80U04 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pja2Q80U04 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pja2Q80U04 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pja2Q80U04 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pja2Q80U04 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pja2Q80U04 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pja2Q80U04 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pja2Q80U04 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms