Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdh8Q7TSK3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdh8Q7TSK3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdh8Q7TSK3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdh8Q7TSK3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdh8Q7TSK3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdh8Q7TSK3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdh8Q7TSK3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdh8Q7TSK3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdh8Q7TSK3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdh8Q7TSK3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdh8Q7TSK3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdh8Q7TSK3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdh8Q7TSK3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcdh8Q7TSK3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdh8Q7TSK3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdh8Q7TSK3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdh8Q7TSK3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdh8Q7TSK3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdh8Q7TSK3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdh8Q7TSK3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdh8Q7TSK3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdh8Q7TSK3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdh8Q7TSK3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdh8Q7TSK3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdh8Q7TSK3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdh8Q7TSK3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdh8Q7TSK3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdh8Q7TSK3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdh8Q7TSK3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdh8Q7TSK3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdh8Q7TSK3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdh8Q7TSK3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdh8Q7TSK3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdh8Q7TSK3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdh8Q7TSK3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdh8Q7TSK3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh8Q7TSK3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh8Q7TSK3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh8Q7TSK3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh8Q7TSK3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh8Q7TSK3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh8Q7TSK3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh8Q7TSK3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh8Q7TSK3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh8Q7TSK3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh8Q7TSK3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdh8Q7TSK3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdh8Q7TSK3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdh8Q7TSK3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdh8Q7TSK3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdh8Q7TSK3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdh8Q7TSK3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdh8Q7TSK3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdh8Q7TSK3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdh8Q7TSK3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdh8Q7TSK3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdh8Q7TSK3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdh8Q7TSK3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdh8Q7TSK3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdh8Q7TSK3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdh8Q7TSK3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdh8Q7TSK3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh8Q7TSK3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh8Q7TSK3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh8Q7TSK3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pcdh8Q7TSK3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh8Q7TSK3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh8Q7TSK3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh8Q7TSK3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh8Q7TSK3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh8Q7TSK3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh8Q7TSK3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh8Q7TSK3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh8Q7TSK3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdh8Q7TSK3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdh8Q7TSK3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdh8Q7TSK3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdh8Q7TSK3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdh8Q7TSK3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdh8Q7TSK3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdh8Q7TSK3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdh8Q7TSK3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdh8Q7TSK3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdh8Q7TSK3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdh8Q7TSK3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdh8Q7TSK3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdh8Q7TSK3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdh8Q7TSK3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdh8Q7TSK3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdh8Q7TSK3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdh8Q7TSK3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pcdh8Q7TSK3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdh8Q7TSK3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdh8Q7TSK3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdh8Q7TSK3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdh8Q7TSK3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdh8Q7TSK3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdh8Q7TSK3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdh8Q7TSK3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms