Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccp110Q7TSH4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccp110Q7TSH4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccp110Q7TSH4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccp110Q7TSH4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccp110Q7TSH4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccp110Q7TSH4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccp110Q7TSH4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccp110Q7TSH4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccp110Q7TSH4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccp110Q7TSH4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccp110Q7TSH4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccp110Q7TSH4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccp110Q7TSH4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccp110Q7TSH4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccp110Q7TSH4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccp110Q7TSH4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccp110Q7TSH4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccp110Q7TSH4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccp110Q7TSH4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccp110Q7TSH4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccp110Q7TSH4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccp110Q7TSH4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccp110Q7TSH4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccp110Q7TSH4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccp110Q7TSH4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccp110Q7TSH4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccp110Q7TSH4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccp110Q7TSH4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccp110Q7TSH4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccp110Q7TSH4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccp110Q7TSH4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccp110Q7TSH4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccp110Q7TSH4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccp110Q7TSH4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccp110Q7TSH4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccp110Q7TSH4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccp110Q7TSH4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccp110Q7TSH4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccp110Q7TSH4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccp110Q7TSH4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccp110Q7TSH4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccp110Q7TSH4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccp110Q7TSH4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccp110Q7TSH4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccp110Q7TSH4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccp110Q7TSH4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccp110Q7TSH4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccp110Q7TSH4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccp110Q7TSH4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccp110Q7TSH4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccp110Q7TSH4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccp110Q7TSH4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccp110Q7TSH4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccp110Q7TSH4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccp110Q7TSH4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccp110Q7TSH4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccp110Q7TSH4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccp110Q7TSH4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccp110Q7TSH4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccp110Q7TSH4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccp110Q7TSH4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccp110Q7TSH4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccp110Q7TSH4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccp110Q7TSH4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccp110Q7TSH4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccp110Q7TSH4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccp110Q7TSH4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccp110Q7TSH4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccp110Q7TSH4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccp110Q7TSH4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccp110Q7TSH4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccp110Q7TSH4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccp110Q7TSH4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccp110Q7TSH4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccp110Q7TSH4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccp110Q7TSH4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccp110Q7TSH4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccp110Q7TSH4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccp110Q7TSH4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccp110Q7TSH4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccp110Q7TSH4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccp110Q7TSH4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccp110Q7TSH4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccp110Q7TSH4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccp110Q7TSH4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccp110Q7TSH4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccp110Q7TSH4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccp110Q7TSH4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccp110Q7TSH4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccp110Q7TSH4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccp110Q7TSH4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccp110Q7TSH4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccp110Q7TSH4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccp110Q7TSH4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccp110Q7TSH4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccp110Q7TSH4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccp110Q7TSH4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccp110Q7TSH4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccp110Q7TSH4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms