Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek5Q7TSC3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek5Q7TSC3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nek5Q7TSC3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek5Q7TSC3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek5Q7TSC3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek5Q7TSC3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek5Q7TSC3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek5Q7TSC3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek5Q7TSC3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek5Q7TSC3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek5Q7TSC3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nek5Q7TSC3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nek5Q7TSC3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nek5Q7TSC3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek5Q7TSC3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek5Q7TSC3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek5Q7TSC3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek5Q7TSC3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek5Q7TSC3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek5Q7TSC3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek5Q7TSC3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek5Q7TSC3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek5Q7TSC3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek5Q7TSC3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek5Q7TSC3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek5Q7TSC3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek5Q7TSC3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek5Q7TSC3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek5Q7TSC3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek5Q7TSC3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek5Q7TSC3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek5Q7TSC3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek5Q7TSC3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nek5Q7TSC3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nek5Q7TSC3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nek5Q7TSC3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nek5Q7TSC3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nek5Q7TSC3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek5Q7TSC3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek5Q7TSC3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek5Q7TSC3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek5Q7TSC3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek5Q7TSC3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nek5Q7TSC3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nek5Q7TSC3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nek5Q7TSC3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nek5Q7TSC3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nek5Q7TSC3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek5Q7TSC3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek5Q7TSC3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek5Q7TSC3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek5Q7TSC3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek5Q7TSC3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek5Q7TSC3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek5Q7TSC3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nek5Q7TSC3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nek5Q7TSC3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nek5Q7TSC3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nek5Q7TSC3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nek5Q7TSC3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek5Q7TSC3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek5Q7TSC3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek5Q7TSC3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nek5Q7TSC3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nek5Q7TSC3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nek5Q7TSC3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nek5Q7TSC3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nek5Q7TSC3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nek5Q7TSC3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nek5Q7TSC3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nek5Q7TSC3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nek5Q7TSC3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nek5Q7TSC3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nek5Q7TSC3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nek5Q7TSC3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nek5Q7TSC3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nek5Q7TSC3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nek5Q7TSC3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nek5Q7TSC3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nek5Q7TSC3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nek5Q7TSC3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek5Q7TSC3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nek5Q7TSC3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nek5Q7TSC3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nek5Q7TSC3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nek5Q7TSC3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nek5Q7TSC3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nek5Q7TSC3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nek5Q7TSC3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nek5Q7TSC3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nek5Q7TSC3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nek5Q7TSC3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nek5Q7TSC3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nek5Q7TSC3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nek5Q7TSC3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nek5Q7TSC3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek5Q7TSC3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek5Q7TSC3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek5Q7TSC3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms