Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfsf18Q7TS55 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfsf18Q7TS55 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfsf18Q7TS55 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfsf18Q7TS55 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfsf18Q7TS55 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfsf18Q7TS55 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfsf18Q7TS55 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfsf18Q7TS55 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfsf18Q7TS55 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfsf18Q7TS55 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfsf18Q7TS55 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfsf18Q7TS55 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfsf18Q7TS55 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfsf18Q7TS55 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfsf18Q7TS55 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfsf18Q7TS55 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfsf18Q7TS55 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfsf18Q7TS55 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfsf18Q7TS55 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfsf18Q7TS55 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfsf18Q7TS55 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfsf18Q7TS55 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfsf18Q7TS55 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf18Q7TS55 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf18Q7TS55 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf18Q7TS55 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf18Q7TS55 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf18Q7TS55 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf18Q7TS55 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf18Q7TS55 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf18Q7TS55 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf18Q7TS55 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf18Q7TS55 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf18Q7TS55 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf18Q7TS55 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf18Q7TS55 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf18Q7TS55 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf18Q7TS55 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf18Q7TS55 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf18Q7TS55 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf18Q7TS55 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf18Q7TS55 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf18Q7TS55 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf18Q7TS55 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf18Q7TS55 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf18Q7TS55 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf18Q7TS55 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf18Q7TS55 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf18Q7TS55 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf18Q7TS55 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf18Q7TS55 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf18Q7TS55 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf18Q7TS55 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf18Q7TS55 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf18Q7TS55 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf18Q7TS55 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfsf18Q7TS55 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfsf18Q7TS55 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfsf18Q7TS55 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfsf18Q7TS55 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfsf18Q7TS55 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfsf18Q7TS55 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfsf18Q7TS55 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf18Q7TS55 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf18Q7TS55 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf18Q7TS55 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf18Q7TS55 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf18Q7TS55 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnfsf18Q7TS55 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfsf18Q7TS55 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnfsf18Q7TS55 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf18Q7TS55 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnfsf18Q7TS55 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf18Q7TS55 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf18Q7TS55 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf18Q7TS55 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf18Q7TS55 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf18Q7TS55 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnfsf18Q7TS55 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf18Q7TS55 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf18Q7TS55 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf18Q7TS55 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf18Q7TS55 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf18Q7TS55 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf18Q7TS55 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf18Q7TS55 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf18Q7TS55 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf18Q7TS55 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf18Q7TS55 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf18Q7TS55 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf18Q7TS55 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf18Q7TS55 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf18Q7TS55 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf18Q7TS55 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf18Q7TS55 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf18Q7TS55 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf18Q7TS55 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms