Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQC5

Aptx, Aprataxin, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AptxQ7TQC5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AptxQ7TQC5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AptxQ7TQC5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AptxQ7TQC5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AptxQ7TQC5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AptxQ7TQC5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AptxQ7TQC5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AptxQ7TQC5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AptxQ7TQC5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AptxQ7TQC5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AptxQ7TQC5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AptxQ7TQC5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AptxQ7TQC5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AptxQ7TQC5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AptxQ7TQC5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AptxQ7TQC5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AptxQ7TQC5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AptxQ7TQC5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AptxQ7TQC5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AptxQ7TQC5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AptxQ7TQC5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AptxQ7TQC5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AptxQ7TQC5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AptxQ7TQC5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AptxQ7TQC5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AptxQ7TQC5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AptxQ7TQC5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AptxQ7TQC5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AptxQ7TQC5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AptxQ7TQC5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AptxQ7TQC5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AptxQ7TQC5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AptxQ7TQC5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AptxQ7TQC5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AptxQ7TQC5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AptxQ7TQC5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AptxQ7TQC5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AptxQ7TQC5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AptxQ7TQC5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AptxQ7TQC5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AptxQ7TQC5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AptxQ7TQC5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AptxQ7TQC5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AptxQ7TQC5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AptxQ7TQC5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AptxQ7TQC5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AptxQ7TQC5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AptxQ7TQC5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AptxQ7TQC5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AptxQ7TQC5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AptxQ7TQC5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AptxQ7TQC5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AptxQ7TQC5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AptxQ7TQC5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AptxQ7TQC5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AptxQ7TQC5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AptxQ7TQC5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AptxQ7TQC5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AptxQ7TQC5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AptxQ7TQC5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AptxQ7TQC5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AptxQ7TQC5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AptxQ7TQC5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AptxQ7TQC5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AptxQ7TQC5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AptxQ7TQC5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AptxQ7TQC5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AptxQ7TQC5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AptxQ7TQC5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AptxQ7TQC5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AptxQ7TQC5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AptxQ7TQC5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AptxQ7TQC5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AptxQ7TQC5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
AptxQ7TQC5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AptxQ7TQC5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AptxQ7TQC5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AptxQ7TQC5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AptxQ7TQC5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AptxQ7TQC5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AptxQ7TQC5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AptxQ7TQC5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AptxQ7TQC5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AptxQ7TQC5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AptxQ7TQC5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AptxQ7TQC5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AptxQ7TQC5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AptxQ7TQC5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AptxQ7TQC5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AptxQ7TQC5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AptxQ7TQC5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AptxQ7TQC5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AptxQ7TQC5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AptxQ7TQC5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AptxQ7TQC5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AptxQ7TQC5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AptxQ7TQC5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AptxQ7TQC5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AptxQ7TQC5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AptxQ7TQC5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms