Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNE1

Sugct, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SugctQ7TNE1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SugctQ7TNE1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SugctQ7TNE1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SugctQ7TNE1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SugctQ7TNE1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SugctQ7TNE1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SugctQ7TNE1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SugctQ7TNE1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SugctQ7TNE1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SugctQ7TNE1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SugctQ7TNE1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SugctQ7TNE1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SugctQ7TNE1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SugctQ7TNE1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SugctQ7TNE1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SugctQ7TNE1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SugctQ7TNE1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SugctQ7TNE1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SugctQ7TNE1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SugctQ7TNE1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SugctQ7TNE1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SugctQ7TNE1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SugctQ7TNE1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SugctQ7TNE1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SugctQ7TNE1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SugctQ7TNE1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SugctQ7TNE1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SugctQ7TNE1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SugctQ7TNE1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SugctQ7TNE1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SugctQ7TNE1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SugctQ7TNE1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SugctQ7TNE1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SugctQ7TNE1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SugctQ7TNE1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SugctQ7TNE1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SugctQ7TNE1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SugctQ7TNE1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SugctQ7TNE1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SugctQ7TNE1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SugctQ7TNE1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SugctQ7TNE1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SugctQ7TNE1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SugctQ7TNE1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SugctQ7TNE1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SugctQ7TNE1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SugctQ7TNE1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SugctQ7TNE1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SugctQ7TNE1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SugctQ7TNE1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SugctQ7TNE1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SugctQ7TNE1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SugctQ7TNE1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SugctQ7TNE1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SugctQ7TNE1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SugctQ7TNE1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SugctQ7TNE1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SugctQ7TNE1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SugctQ7TNE1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SugctQ7TNE1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SugctQ7TNE1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SugctQ7TNE1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SugctQ7TNE1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SugctQ7TNE1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SugctQ7TNE1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SugctQ7TNE1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SugctQ7TNE1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SugctQ7TNE1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SugctQ7TNE1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SugctQ7TNE1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SugctQ7TNE1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SugctQ7TNE1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SugctQ7TNE1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SugctQ7TNE1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SugctQ7TNE1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SugctQ7TNE1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SugctQ7TNE1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SugctQ7TNE1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SugctQ7TNE1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SugctQ7TNE1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SugctQ7TNE1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SugctQ7TNE1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SugctQ7TNE1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SugctQ7TNE1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SugctQ7TNE1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SugctQ7TNE1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SugctQ7TNE1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SugctQ7TNE1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SugctQ7TNE1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SugctQ7TNE1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SugctQ7TNE1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SugctQ7TNE1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SugctQ7TNE1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SugctQ7TNE1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SugctQ7TNE1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SugctQ7TNE1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SugctQ7TNE1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SugctQ7TNE1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SugctQ7TNE1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SugctQ7TNE1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms