Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMK9

Syncrip, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncripQ7TMK9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SyncripQ7TMK9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SyncripQ7TMK9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SyncripQ7TMK9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SyncripQ7TMK9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SyncripQ7TMK9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SyncripQ7TMK9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SyncripQ7TMK9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SyncripQ7TMK9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SyncripQ7TMK9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SyncripQ7TMK9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SyncripQ7TMK9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SyncripQ7TMK9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SyncripQ7TMK9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SyncripQ7TMK9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SyncripQ7TMK9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SyncripQ7TMK9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SyncripQ7TMK9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SyncripQ7TMK9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SyncripQ7TMK9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SyncripQ7TMK9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SyncripQ7TMK9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SyncripQ7TMK9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SyncripQ7TMK9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SyncripQ7TMK9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SyncripQ7TMK9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SyncripQ7TMK9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SyncripQ7TMK9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SyncripQ7TMK9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SyncripQ7TMK9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SyncripQ7TMK9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SyncripQ7TMK9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SyncripQ7TMK9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SyncripQ7TMK9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SyncripQ7TMK9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SyncripQ7TMK9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SyncripQ7TMK9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SyncripQ7TMK9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SyncripQ7TMK9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SyncripQ7TMK9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SyncripQ7TMK9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SyncripQ7TMK9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SyncripQ7TMK9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SyncripQ7TMK9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SyncripQ7TMK9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SyncripQ7TMK9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SyncripQ7TMK9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SyncripQ7TMK9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SyncripQ7TMK9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SyncripQ7TMK9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SyncripQ7TMK9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SyncripQ7TMK9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SyncripQ7TMK9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SyncripQ7TMK9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SyncripQ7TMK9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SyncripQ7TMK9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SyncripQ7TMK9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SyncripQ7TMK9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SyncripQ7TMK9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SyncripQ7TMK9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SyncripQ7TMK9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SyncripQ7TMK9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SyncripQ7TMK9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SyncripQ7TMK9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SyncripQ7TMK9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SyncripQ7TMK9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SyncripQ7TMK9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SyncripQ7TMK9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SyncripQ7TMK9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SyncripQ7TMK9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SyncripQ7TMK9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SyncripQ7TMK9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SyncripQ7TMK9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SyncripQ7TMK9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SyncripQ7TMK9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SyncripQ7TMK9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SyncripQ7TMK9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SyncripQ7TMK9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SyncripQ7TMK9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SyncripQ7TMK9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SyncripQ7TMK9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SyncripQ7TMK9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SyncripQ7TMK9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SyncripQ7TMK9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SyncripQ7TMK9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SyncripQ7TMK9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SyncripQ7TMK9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SyncripQ7TMK9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SyncripQ7TMK9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SyncripQ7TMK9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SyncripQ7TMK9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SyncripQ7TMK9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SyncripQ7TMK9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SyncripQ7TMK9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SyncripQ7TMK9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SyncripQ7TMK9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SyncripQ7TMK9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SyncripQ7TMK9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SyncripQ7TMK9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SyncripQ7TMK9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms