Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Higd1cQ76I25 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Higd1cQ76I25 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Higd1cQ76I25 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Higd1cQ76I25 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Higd1cQ76I25 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Higd1cQ76I25 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Higd1cQ76I25 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Higd1cQ76I25 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Higd1cQ76I25 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Higd1cQ76I25 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Higd1cQ76I25 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Higd1cQ76I25 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Higd1cQ76I25 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Higd1cQ76I25 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Higd1cQ76I25 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Higd1cQ76I25 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Higd1cQ76I25 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Higd1cQ76I25 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Higd1cQ76I25 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Higd1cQ76I25 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Higd1cQ76I25 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Higd1cQ76I25 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Higd1cQ76I25 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Higd1cQ76I25 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Higd1cQ76I25 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Higd1cQ76I25 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Higd1cQ76I25 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Higd1cQ76I25 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Higd1cQ76I25 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Higd1cQ76I25 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Higd1cQ76I25 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Higd1cQ76I25 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Higd1cQ76I25 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Higd1cQ76I25 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Higd1cQ76I25 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Higd1cQ76I25 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Higd1cQ76I25 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Higd1cQ76I25 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Higd1cQ76I25 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Higd1cQ76I25 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Higd1cQ76I25 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Higd1cQ76I25 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Higd1cQ76I25 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Higd1cQ76I25 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Higd1cQ76I25 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Higd1cQ76I25 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Higd1cQ76I25 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Higd1cQ76I25 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Higd1cQ76I25 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Higd1cQ76I25 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Higd1cQ76I25 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Higd1cQ76I25 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Higd1cQ76I25 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Higd1cQ76I25 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Higd1cQ76I25 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Higd1cQ76I25 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Higd1cQ76I25 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Higd1cQ76I25 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Higd1cQ76I25 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Higd1cQ76I25 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Higd1cQ76I25 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Higd1cQ76I25 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Higd1cQ76I25 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Higd1cQ76I25 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Higd1cQ76I25 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Higd1cQ76I25 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Higd1cQ76I25 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Higd1cQ76I25 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Higd1cQ76I25 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Higd1cQ76I25 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Higd1cQ76I25 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Higd1cQ76I25 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Higd1cQ76I25 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Higd1cQ76I25 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Higd1cQ76I25 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Higd1cQ76I25 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Higd1cQ76I25 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Higd1cQ76I25 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Higd1cQ76I25 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Higd1cQ76I25 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Higd1cQ76I25 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Higd1cQ76I25 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Higd1cQ76I25 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Higd1cQ76I25 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Higd1cQ76I25 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Higd1cQ76I25 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Higd1cQ76I25 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Higd1cQ76I25 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Higd1cQ76I25 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Higd1cQ76I25 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Higd1cQ76I25 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Higd1cQ76I25 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Higd1cQ76I25 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Higd1cQ76I25 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Higd1cQ76I25 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Higd1cQ76I25 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Higd1cQ76I25 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Higd1cQ76I25 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Higd1cQ76I25 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms