Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube2r2Q6ZWZ2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube2r2Q6ZWZ2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube2r2Q6ZWZ2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube2r2Q6ZWZ2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube2r2Q6ZWZ2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube2r2Q6ZWZ2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube2r2Q6ZWZ2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube2r2Q6ZWZ2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube2r2Q6ZWZ2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube2r2Q6ZWZ2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube2r2Q6ZWZ2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube2r2Q6ZWZ2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ube2r2Q6ZWZ2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms