Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ift172Q6VH22 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ift172Q6VH22 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ift172Q6VH22 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ift172Q6VH22 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Ift172Q6VH22 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ift172Q6VH22 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ift172Q6VH22 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ift172Q6VH22 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Ift172Q6VH22 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
Ift172Q6VH22 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ift172Q6VH22 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ift172Q6VH22 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ift172Q6VH22 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Ift172Q6VH22 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ift172Q6VH22 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ift172Q6VH22 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ift172Q6VH22 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ift172Q6VH22 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Ift172Q6VH22 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ift172Q6VH22 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ift172Q6VH22 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ift172Q6VH22 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ift172Q6VH22 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ift172Q6VH22 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Ift172Q6VH22 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ift172Q6VH22 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ift172Q6VH22 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ift172Q6VH22 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Ift172Q6VH22 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Ift172Q6VH22 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ift172Q6VH22 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ift172Q6VH22 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ift172Q6VH22 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ift172Q6VH22 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ift172Q6VH22 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ift172Q6VH22 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ift172Q6VH22 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ift172Q6VH22 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ift172Q6VH22 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ift172Q6VH22 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Ift172Q6VH22 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ift172Q6VH22 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ift172Q6VH22 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Ift172Q6VH22 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ift172Q6VH22 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Ift172Q6VH22 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ift172Q6VH22 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ift172Q6VH22 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ift172Q6VH22 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ift172Q6VH22 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ift172Q6VH22 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ift172Q6VH22 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ift172Q6VH22 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ift172Q6VH22 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ift172Q6VH22 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ift172Q6VH22 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ift172Q6VH22 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ift172Q6VH22 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ift172Q6VH22 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ift172Q6VH22 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Ift172Q6VH22 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ift172Q6VH22 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ift172Q6VH22 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Ift172Q6VH22 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ift172Q6VH22 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ift172Q6VH22 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ift172Q6VH22 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ift172Q6VH22 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ift172Q6VH22 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ift172Q6VH22 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ift172Q6VH22 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ift172Q6VH22 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ift172Q6VH22 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ift172Q6VH22 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ift172Q6VH22 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ift172Q6VH22 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ift172Q6VH22 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ift172Q6VH22 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ift172Q6VH22 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ift172Q6VH22 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ift172Q6VH22 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ift172Q6VH22 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ift172Q6VH22 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ift172Q6VH22 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ift172Q6VH22 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ift172Q6VH22 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ift172Q6VH22 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ift172Q6VH22 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ift172Q6VH22 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ift172Q6VH22 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ift172Q6VH22 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Ift172Q6VH22 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Ift172Q6VH22 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Ift172Q6VH22 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ift172Q6VH22 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ift172Q6VH22 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ift172Q6VH22 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ift172Q6VH22 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ift172Q6VH22 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms