Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY53

AY358078, HN1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY358078Q6UY53 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AY358078Q6UY53 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AY358078Q6UY53 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AY358078Q6UY53 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AY358078Q6UY53 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AY358078Q6UY53 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AY358078Q6UY53 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AY358078Q6UY53 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AY358078Q6UY53 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AY358078Q6UY53 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AY358078Q6UY53 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AY358078Q6UY53 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AY358078Q6UY53 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AY358078Q6UY53 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AY358078Q6UY53 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AY358078Q6UY53 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AY358078Q6UY53 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AY358078Q6UY53 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AY358078Q6UY53 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AY358078Q6UY53 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AY358078Q6UY53 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AY358078Q6UY53 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AY358078Q6UY53 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AY358078Q6UY53 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AY358078Q6UY53 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AY358078Q6UY53 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AY358078Q6UY53 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AY358078Q6UY53 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AY358078Q6UY53 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AY358078Q6UY53 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AY358078Q6UY53 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AY358078Q6UY53 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AY358078Q6UY53 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AY358078Q6UY53 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AY358078Q6UY53 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AY358078Q6UY53 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AY358078Q6UY53 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AY358078Q6UY53 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AY358078Q6UY53 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AY358078Q6UY53 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AY358078Q6UY53 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AY358078Q6UY53 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AY358078Q6UY53 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AY358078Q6UY53 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AY358078Q6UY53 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AY358078Q6UY53 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AY358078Q6UY53 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AY358078Q6UY53 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AY358078Q6UY53 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AY358078Q6UY53 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AY358078Q6UY53 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AY358078Q6UY53 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AY358078Q6UY53 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AY358078Q6UY53 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AY358078Q6UY53 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AY358078Q6UY53 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AY358078Q6UY53 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AY358078Q6UY53 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AY358078Q6UY53 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AY358078Q6UY53 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AY358078Q6UY53 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AY358078Q6UY53 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AY358078Q6UY53 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AY358078Q6UY53 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AY358078Q6UY53 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AY358078Q6UY53 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AY358078Q6UY53 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AY358078Q6UY53 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AY358078Q6UY53 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AY358078Q6UY53 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AY358078Q6UY53 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AY358078Q6UY53 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AY358078Q6UY53 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AY358078Q6UY53 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AY358078Q6UY53 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AY358078Q6UY53 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AY358078Q6UY53 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AY358078Q6UY53 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AY358078Q6UY53 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AY358078Q6UY53 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AY358078Q6UY53 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AY358078Q6UY53 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AY358078Q6UY53 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AY358078Q6UY53 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AY358078Q6UY53 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AY358078Q6UY53 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AY358078Q6UY53 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AY358078Q6UY53 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AY358078Q6UY53 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AY358078Q6UY53 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AY358078Q6UY53 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AY358078Q6UY53 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AY358078Q6UY53 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AY358078Q6UY53 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AY358078Q6UY53 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AY358078Q6UY53 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AY358078Q6UY53 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AY358078Q6UY53 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AY358078Q6UY53 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AY358078Q6UY53 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms