Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGG2

Gmip, GEM-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GmipQ6PGG2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GmipQ6PGG2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GmipQ6PGG2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GmipQ6PGG2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GmipQ6PGG2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GmipQ6PGG2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GmipQ6PGG2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GmipQ6PGG2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GmipQ6PGG2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GmipQ6PGG2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GmipQ6PGG2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GmipQ6PGG2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GmipQ6PGG2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GmipQ6PGG2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GmipQ6PGG2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GmipQ6PGG2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GmipQ6PGG2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GmipQ6PGG2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GmipQ6PGG2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GmipQ6PGG2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GmipQ6PGG2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GmipQ6PGG2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GmipQ6PGG2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GmipQ6PGG2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GmipQ6PGG2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GmipQ6PGG2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GmipQ6PGG2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GmipQ6PGG2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GmipQ6PGG2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GmipQ6PGG2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GmipQ6PGG2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GmipQ6PGG2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GmipQ6PGG2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GmipQ6PGG2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GmipQ6PGG2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GmipQ6PGG2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GmipQ6PGG2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GmipQ6PGG2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GmipQ6PGG2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GmipQ6PGG2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GmipQ6PGG2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GmipQ6PGG2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GmipQ6PGG2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GmipQ6PGG2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GmipQ6PGG2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GmipQ6PGG2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GmipQ6PGG2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GmipQ6PGG2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GmipQ6PGG2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GmipQ6PGG2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GmipQ6PGG2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GmipQ6PGG2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GmipQ6PGG2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GmipQ6PGG2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GmipQ6PGG2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GmipQ6PGG2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GmipQ6PGG2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GmipQ6PGG2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GmipQ6PGG2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GmipQ6PGG2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GmipQ6PGG2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GmipQ6PGG2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GmipQ6PGG2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GmipQ6PGG2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GmipQ6PGG2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GmipQ6PGG2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GmipQ6PGG2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GmipQ6PGG2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GmipQ6PGG2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GmipQ6PGG2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GmipQ6PGG2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GmipQ6PGG2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GmipQ6PGG2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GmipQ6PGG2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GmipQ6PGG2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GmipQ6PGG2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GmipQ6PGG2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GmipQ6PGG2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GmipQ6PGG2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GmipQ6PGG2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GmipQ6PGG2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GmipQ6PGG2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GmipQ6PGG2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GmipQ6PGG2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GmipQ6PGG2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GmipQ6PGG2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GmipQ6PGG2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GmipQ6PGG2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GmipQ6PGG2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GmipQ6PGG2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GmipQ6PGG2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GmipQ6PGG2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GmipQ6PGG2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GmipQ6PGG2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GmipQ6PGG2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GmipQ6PGG2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GmipQ6PGG2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GmipQ6PGG2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GmipQ6PGG2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GmipQ6PGG2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms