Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bhlhb9Q6PB60 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Bhlhb9Q6PB60 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bhlhb9Q6PB60 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bhlhb9Q6PB60 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bhlhb9Q6PB60 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bhlhb9Q6PB60 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bhlhb9Q6PB60 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bhlhb9Q6PB60 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bhlhb9Q6PB60 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bhlhb9Q6PB60 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Bhlhb9Q6PB60 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bhlhb9Q6PB60 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bhlhb9Q6PB60 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Bhlhb9Q6PB60 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bhlhb9Q6PB60 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bhlhb9Q6PB60 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bhlhb9Q6PB60 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bhlhb9Q6PB60 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bhlhb9Q6PB60 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bhlhb9Q6PB60 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bhlhb9Q6PB60 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bhlhb9Q6PB60 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bhlhb9Q6PB60 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bhlhb9Q6PB60 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bhlhb9Q6PB60 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bhlhb9Q6PB60 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Bhlhb9Q6PB60 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bhlhb9Q6PB60 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bhlhb9Q6PB60 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bhlhb9Q6PB60 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bhlhb9Q6PB60 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bhlhb9Q6PB60 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bhlhb9Q6PB60 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bhlhb9Q6PB60 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bhlhb9Q6PB60 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bhlhb9Q6PB60 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bhlhb9Q6PB60 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bhlhb9Q6PB60 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bhlhb9Q6PB60 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bhlhb9Q6PB60 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bhlhb9Q6PB60 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bhlhb9Q6PB60 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bhlhb9Q6PB60 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Bhlhb9Q6PB60 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bhlhb9Q6PB60 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bhlhb9Q6PB60 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Bhlhb9Q6PB60 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bhlhb9Q6PB60 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bhlhb9Q6PB60 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bhlhb9Q6PB60 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bhlhb9Q6PB60 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bhlhb9Q6PB60 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bhlhb9Q6PB60 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bhlhb9Q6PB60 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bhlhb9Q6PB60 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bhlhb9Q6PB60 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bhlhb9Q6PB60 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bhlhb9Q6PB60 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bhlhb9Q6PB60 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Bhlhb9Q6PB60 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Bhlhb9Q6PB60 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bhlhb9Q6PB60 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bhlhb9Q6PB60 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bhlhb9Q6PB60 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bhlhb9Q6PB60 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Bhlhb9Q6PB60 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bhlhb9Q6PB60 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bhlhb9Q6PB60 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bhlhb9Q6PB60 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bhlhb9Q6PB60 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Bhlhb9Q6PB60 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bhlhb9Q6PB60 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bhlhb9Q6PB60 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bhlhb9Q6PB60 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bhlhb9Q6PB60 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bhlhb9Q6PB60 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bhlhb9Q6PB60 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bhlhb9Q6PB60 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bhlhb9Q6PB60 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bhlhb9Q6PB60 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bhlhb9Q6PB60 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bhlhb9Q6PB60 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bhlhb9Q6PB60 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bhlhb9Q6PB60 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bhlhb9Q6PB60 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bhlhb9Q6PB60 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Bhlhb9Q6PB60 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bhlhb9Q6PB60 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bhlhb9Q6PB60 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bhlhb9Q6PB60 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bhlhb9Q6PB60 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bhlhb9Q6PB60 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bhlhb9Q6PB60 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bhlhb9Q6PB60 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bhlhb9Q6PB60 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Bhlhb9Q6PB60 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bhlhb9Q6PB60 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bhlhb9Q6PB60 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bhlhb9Q6PB60 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms