Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K8

Cpa4, Carboxypeptidase A4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa4Q6P8K8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cpa4Q6P8K8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cpa4Q6P8K8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cpa4Q6P8K8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cpa4Q6P8K8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cpa4Q6P8K8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cpa4Q6P8K8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cpa4Q6P8K8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cpa4Q6P8K8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cpa4Q6P8K8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cpa4Q6P8K8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cpa4Q6P8K8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cpa4Q6P8K8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cpa4Q6P8K8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cpa4Q6P8K8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cpa4Q6P8K8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cpa4Q6P8K8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cpa4Q6P8K8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cpa4Q6P8K8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpa4Q6P8K8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpa4Q6P8K8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpa4Q6P8K8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpa4Q6P8K8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpa4Q6P8K8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpa4Q6P8K8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpa4Q6P8K8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpa4Q6P8K8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpa4Q6P8K8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpa4Q6P8K8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cpa4Q6P8K8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cpa4Q6P8K8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cpa4Q6P8K8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cpa4Q6P8K8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cpa4Q6P8K8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cpa4Q6P8K8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cpa4Q6P8K8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cpa4Q6P8K8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cpa4Q6P8K8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cpa4Q6P8K8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cpa4Q6P8K8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cpa4Q6P8K8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cpa4Q6P8K8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpa4Q6P8K8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpa4Q6P8K8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpa4Q6P8K8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpa4Q6P8K8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cpa4Q6P8K8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cpa4Q6P8K8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cpa4Q6P8K8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpa4Q6P8K8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpa4Q6P8K8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpa4Q6P8K8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpa4Q6P8K8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cpa4Q6P8K8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cpa4Q6P8K8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cpa4Q6P8K8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpa4Q6P8K8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpa4Q6P8K8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpa4Q6P8K8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cpa4Q6P8K8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cpa4Q6P8K8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cpa4Q6P8K8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cpa4Q6P8K8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cpa4Q6P8K8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cpa4Q6P8K8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cpa4Q6P8K8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cpa4Q6P8K8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cpa4Q6P8K8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cpa4Q6P8K8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cpa4Q6P8K8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cpa4Q6P8K8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cpa4Q6P8K8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cpa4Q6P8K8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cpa4Q6P8K8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cpa4Q6P8K8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cpa4Q6P8K8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cpa4Q6P8K8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cpa4Q6P8K8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cpa4Q6P8K8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cpa4Q6P8K8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cpa4Q6P8K8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpa4Q6P8K8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpa4Q6P8K8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpa4Q6P8K8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cpa4Q6P8K8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cpa4Q6P8K8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cpa4Q6P8K8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cpa4Q6P8K8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cpa4Q6P8K8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cpa4Q6P8K8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cpa4Q6P8K8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cpa4Q6P8K8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cpa4Q6P8K8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cpa4Q6P8K8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cpa4Q6P8K8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cpa4Q6P8K8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cpa4Q6P8K8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cpa4Q6P8K8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cpa4Q6P8K8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cpa4Q6P8K8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms