Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5F9

Xpo1, Exportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,071 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpo1Q6P5F9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Xpo1Q6P5F9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Xpo1Q6P5F9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Xpo1Q6P5F9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Xpo1Q6P5F9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Xpo1Q6P5F9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Xpo1Q6P5F9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Xpo1Q6P5F9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Xpo1Q6P5F9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Xpo1Q6P5F9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xpo1Q6P5F9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xpo1Q6P5F9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xpo1Q6P5F9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xpo1Q6P5F9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Xpo1Q6P5F9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Xpo1Q6P5F9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Xpo1Q6P5F9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Xpo1Q6P5F9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Xpo1Q6P5F9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Xpo1Q6P5F9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xpo1Q6P5F9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Xpo1Q6P5F9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Xpo1Q6P5F9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Xpo1Q6P5F9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Xpo1Q6P5F9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Xpo1Q6P5F9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Xpo1Q6P5F9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xpo1Q6P5F9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xpo1Q6P5F9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xpo1Q6P5F9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Xpo1Q6P5F9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xpo1Q6P5F9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xpo1Q6P5F9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xpo1Q6P5F9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Xpo1Q6P5F9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Xpo1Q6P5F9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Xpo1Q6P5F9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Xpo1Q6P5F9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Xpo1Q6P5F9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Xpo1Q6P5F9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Xpo1Q6P5F9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Xpo1Q6P5F9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xpo1Q6P5F9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Xpo1Q6P5F9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Xpo1Q6P5F9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Xpo1Q6P5F9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Xpo1Q6P5F9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Xpo1Q6P5F9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xpo1Q6P5F9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xpo1Q6P5F9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xpo1Q6P5F9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xpo1Q6P5F9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xpo1Q6P5F9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Xpo1Q6P5F9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Xpo1Q6P5F9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xpo1Q6P5F9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xpo1Q6P5F9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xpo1Q6P5F9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xpo1Q6P5F9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xpo1Q6P5F9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xpo1Q6P5F9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xpo1Q6P5F9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Xpo1Q6P5F9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Xpo1Q6P5F9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xpo1Q6P5F9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xpo1Q6P5F9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xpo1Q6P5F9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xpo1Q6P5F9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xpo1Q6P5F9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Xpo1Q6P5F9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xpo1Q6P5F9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Xpo1Q6P5F9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xpo1Q6P5F9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xpo1Q6P5F9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xpo1Q6P5F9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xpo1Q6P5F9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Xpo1Q6P5F9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Xpo1Q6P5F9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xpo1Q6P5F9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xpo1Q6P5F9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xpo1Q6P5F9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xpo1Q6P5F9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Xpo1Q6P5F9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Xpo1Q6P5F9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Xpo1Q6P5F9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Xpo1Q6P5F9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Xpo1Q6P5F9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Xpo1Q6P5F9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xpo1Q6P5F9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xpo1Q6P5F9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xpo1Q6P5F9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Xpo1Q6P5F9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xpo1Q6P5F9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xpo1Q6P5F9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xpo1Q6P5F9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xpo1Q6P5F9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Xpo1Q6P5F9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xpo1Q6P5F9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xpo1Q6P5F9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xpo1Q6P5F9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms