Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Podnl1Q6P3Y9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Podnl1Q6P3Y9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Podnl1Q6P3Y9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Podnl1Q6P3Y9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Podnl1Q6P3Y9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Podnl1Q6P3Y9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Podnl1Q6P3Y9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Podnl1Q6P3Y9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Podnl1Q6P3Y9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Podnl1Q6P3Y9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Podnl1Q6P3Y9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Podnl1Q6P3Y9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Podnl1Q6P3Y9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Podnl1Q6P3Y9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Podnl1Q6P3Y9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Podnl1Q6P3Y9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Podnl1Q6P3Y9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Podnl1Q6P3Y9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Podnl1Q6P3Y9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Podnl1Q6P3Y9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Podnl1Q6P3Y9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Podnl1Q6P3Y9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Podnl1Q6P3Y9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Podnl1Q6P3Y9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Podnl1Q6P3Y9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Podnl1Q6P3Y9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Podnl1Q6P3Y9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Podnl1Q6P3Y9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Podnl1Q6P3Y9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Podnl1Q6P3Y9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Podnl1Q6P3Y9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Podnl1Q6P3Y9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Podnl1Q6P3Y9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Podnl1Q6P3Y9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Podnl1Q6P3Y9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Podnl1Q6P3Y9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Podnl1Q6P3Y9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Podnl1Q6P3Y9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Podnl1Q6P3Y9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Podnl1Q6P3Y9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Podnl1Q6P3Y9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Podnl1Q6P3Y9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Podnl1Q6P3Y9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Podnl1Q6P3Y9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Podnl1Q6P3Y9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Podnl1Q6P3Y9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Podnl1Q6P3Y9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Podnl1Q6P3Y9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Podnl1Q6P3Y9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Podnl1Q6P3Y9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Podnl1Q6P3Y9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Podnl1Q6P3Y9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Podnl1Q6P3Y9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Podnl1Q6P3Y9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Podnl1Q6P3Y9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Podnl1Q6P3Y9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Podnl1Q6P3Y9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Podnl1Q6P3Y9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Podnl1Q6P3Y9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Podnl1Q6P3Y9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Podnl1Q6P3Y9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Podnl1Q6P3Y9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Podnl1Q6P3Y9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Podnl1Q6P3Y9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Podnl1Q6P3Y9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Podnl1Q6P3Y9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Podnl1Q6P3Y9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Podnl1Q6P3Y9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Podnl1Q6P3Y9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Podnl1Q6P3Y9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Podnl1Q6P3Y9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Podnl1Q6P3Y9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Podnl1Q6P3Y9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Podnl1Q6P3Y9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Podnl1Q6P3Y9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Podnl1Q6P3Y9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Podnl1Q6P3Y9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Podnl1Q6P3Y9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Podnl1Q6P3Y9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Podnl1Q6P3Y9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Podnl1Q6P3Y9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Podnl1Q6P3Y9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Podnl1Q6P3Y9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Podnl1Q6P3Y9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Podnl1Q6P3Y9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Podnl1Q6P3Y9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Podnl1Q6P3Y9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Podnl1Q6P3Y9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Podnl1Q6P3Y9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Podnl1Q6P3Y9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Podnl1Q6P3Y9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Podnl1Q6P3Y9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Podnl1Q6P3Y9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Podnl1Q6P3Y9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Podnl1Q6P3Y9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Podnl1Q6P3Y9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Podnl1Q6P3Y9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Podnl1Q6P3Y9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms