Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL8

Scube1, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube1Q6NZL8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scube1Q6NZL8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scube1Q6NZL8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scube1Q6NZL8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scube1Q6NZL8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scube1Q6NZL8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scube1Q6NZL8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scube1Q6NZL8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scube1Q6NZL8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scube1Q6NZL8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Scube1Q6NZL8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scube1Q6NZL8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Scube1Q6NZL8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scube1Q6NZL8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scube1Q6NZL8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scube1Q6NZL8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scube1Q6NZL8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scube1Q6NZL8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scube1Q6NZL8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scube1Q6NZL8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scube1Q6NZL8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scube1Q6NZL8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scube1Q6NZL8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scube1Q6NZL8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scube1Q6NZL8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scube1Q6NZL8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scube1Q6NZL8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scube1Q6NZL8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scube1Q6NZL8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scube1Q6NZL8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scube1Q6NZL8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scube1Q6NZL8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scube1Q6NZL8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scube1Q6NZL8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scube1Q6NZL8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scube1Q6NZL8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scube1Q6NZL8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scube1Q6NZL8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scube1Q6NZL8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scube1Q6NZL8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scube1Q6NZL8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scube1Q6NZL8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scube1Q6NZL8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scube1Q6NZL8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scube1Q6NZL8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scube1Q6NZL8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scube1Q6NZL8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scube1Q6NZL8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Scube1Q6NZL8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scube1Q6NZL8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scube1Q6NZL8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scube1Q6NZL8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scube1Q6NZL8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scube1Q6NZL8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scube1Q6NZL8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Scube1Q6NZL8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scube1Q6NZL8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scube1Q6NZL8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scube1Q6NZL8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scube1Q6NZL8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scube1Q6NZL8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scube1Q6NZL8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scube1Q6NZL8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scube1Q6NZL8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scube1Q6NZL8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scube1Q6NZL8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scube1Q6NZL8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scube1Q6NZL8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scube1Q6NZL8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scube1Q6NZL8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scube1Q6NZL8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scube1Q6NZL8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scube1Q6NZL8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scube1Q6NZL8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scube1Q6NZL8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scube1Q6NZL8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scube1Q6NZL8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scube1Q6NZL8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scube1Q6NZL8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scube1Q6NZL8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scube1Q6NZL8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scube1Q6NZL8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scube1Q6NZL8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Scube1Q6NZL8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scube1Q6NZL8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scube1Q6NZL8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scube1Q6NZL8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scube1Q6NZL8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scube1Q6NZL8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scube1Q6NZL8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scube1Q6NZL8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scube1Q6NZL8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scube1Q6NZL8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scube1Q6NZL8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scube1Q6NZL8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scube1Q6NZL8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scube1Q6NZL8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scube1Q6NZL8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scube1Q6NZL8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scube1Q6NZL8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms