Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SphkapQ6NSW3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SphkapQ6NSW3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SphkapQ6NSW3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SphkapQ6NSW3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
SphkapQ6NSW3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SphkapQ6NSW3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SphkapQ6NSW3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
SphkapQ6NSW3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SphkapQ6NSW3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
SphkapQ6NSW3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SphkapQ6NSW3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SphkapQ6NSW3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
SphkapQ6NSW3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SphkapQ6NSW3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SphkapQ6NSW3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SphkapQ6NSW3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SphkapQ6NSW3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
SphkapQ6NSW3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SphkapQ6NSW3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
SphkapQ6NSW3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SphkapQ6NSW3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SphkapQ6NSW3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SphkapQ6NSW3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SphkapQ6NSW3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SphkapQ6NSW3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SphkapQ6NSW3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SphkapQ6NSW3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SphkapQ6NSW3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SphkapQ6NSW3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SphkapQ6NSW3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SphkapQ6NSW3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SphkapQ6NSW3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SphkapQ6NSW3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SphkapQ6NSW3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SphkapQ6NSW3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SphkapQ6NSW3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SphkapQ6NSW3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SphkapQ6NSW3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SphkapQ6NSW3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
SphkapQ6NSW3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SphkapQ6NSW3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SphkapQ6NSW3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SphkapQ6NSW3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SphkapQ6NSW3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SphkapQ6NSW3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SphkapQ6NSW3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SphkapQ6NSW3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SphkapQ6NSW3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SphkapQ6NSW3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SphkapQ6NSW3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SphkapQ6NSW3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
SphkapQ6NSW3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
SphkapQ6NSW3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
SphkapQ6NSW3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SphkapQ6NSW3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SphkapQ6NSW3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
SphkapQ6NSW3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
SphkapQ6NSW3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SphkapQ6NSW3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SphkapQ6NSW3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SphkapQ6NSW3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SphkapQ6NSW3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SphkapQ6NSW3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
SphkapQ6NSW3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SphkapQ6NSW3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
SphkapQ6NSW3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
SphkapQ6NSW3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SphkapQ6NSW3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
SphkapQ6NSW3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SphkapQ6NSW3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SphkapQ6NSW3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
SphkapQ6NSW3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SphkapQ6NSW3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SphkapQ6NSW3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
SphkapQ6NSW3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SphkapQ6NSW3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SphkapQ6NSW3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SphkapQ6NSW3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SphkapQ6NSW3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SphkapQ6NSW3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SphkapQ6NSW3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
SphkapQ6NSW3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SphkapQ6NSW3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SphkapQ6NSW3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SphkapQ6NSW3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SphkapQ6NSW3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SphkapQ6NSW3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
SphkapQ6NSW3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
SphkapQ6NSW3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
SphkapQ6NSW3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SphkapQ6NSW3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.17
SphkapQ6NSW3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
SphkapQ6NSW3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
SphkapQ6NSW3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
SphkapQ6NSW3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
SphkapQ6NSW3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SphkapQ6NSW3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SphkapQ6NSW3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SphkapQ6NSW3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms