Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS60

Fbxo41, F-box only protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo41Q6NS60 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Fbxo41Q6NS60 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Fbxo41Q6NS60 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Fbxo41Q6NS60 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Fbxo41Q6NS60 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Fbxo41Q6NS60 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Fbxo41Q6NS60 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Fbxo41Q6NS60 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Fbxo41Q6NS60 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Fbxo41Q6NS60 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Fbxo41Q6NS60 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Fbxo41Q6NS60 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Fbxo41Q6NS60 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Fbxo41Q6NS60 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Fbxo41Q6NS60 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Fbxo41Q6NS60 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Fbxo41Q6NS60 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Fbxo41Q6NS60 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Fbxo41Q6NS60 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Fbxo41Q6NS60 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Fbxo41Q6NS60 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Fbxo41Q6NS60 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Fbxo41Q6NS60 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Fbxo41Q6NS60 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Fbxo41Q6NS60 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Fbxo41Q6NS60 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Fbxo41Q6NS60 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Fbxo41Q6NS60 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Fbxo41Q6NS60 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Fbxo41Q6NS60 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Fbxo41Q6NS60 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Fbxo41Q6NS60 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Fbxo41Q6NS60 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Fbxo41Q6NS60 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Fbxo41Q6NS60 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Fbxo41Q6NS60 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Fbxo41Q6NS60 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Fbxo41Q6NS60 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Fbxo41Q6NS60 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Fbxo41Q6NS60 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Fbxo41Q6NS60 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Fbxo41Q6NS60 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Fbxo41Q6NS60 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Fbxo41Q6NS60 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Fbxo41Q6NS60 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Fbxo41Q6NS60 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Fbxo41Q6NS60 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Fbxo41Q6NS60 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Fbxo41Q6NS60 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Fbxo41Q6NS60 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
Fbxo41Q6NS60 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Fbxo41Q6NS60 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Fbxo41Q6NS60 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Fbxo41Q6NS60 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Fbxo41Q6NS60 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Fbxo41Q6NS60 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Fbxo41Q6NS60 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Fbxo41Q6NS60 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Fbxo41Q6NS60 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Fbxo41Q6NS60 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Fbxo41Q6NS60 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Fbxo41Q6NS60 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Fbxo41Q6NS60 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Fbxo41Q6NS60 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Fbxo41Q6NS60 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Fbxo41Q6NS60 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Fbxo41Q6NS60 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Fbxo41Q6NS60 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Fbxo41Q6NS60 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Fbxo41Q6NS60 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Fbxo41Q6NS60 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Fbxo41Q6NS60 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Fbxo41Q6NS60 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Fbxo41Q6NS60 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Fbxo41Q6NS60 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Fbxo41Q6NS60 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Fbxo41Q6NS60 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Fbxo41Q6NS60 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Fbxo41Q6NS60 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Fbxo41Q6NS60 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Fbxo41Q6NS60 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Fbxo41Q6NS60 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Fbxo41Q6NS60 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Fbxo41Q6NS60 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Fbxo41Q6NS60 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Fbxo41Q6NS60 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Fbxo41Q6NS60 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Fbxo41Q6NS60 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Fbxo41Q6NS60 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Fbxo41Q6NS60 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Fbxo41Q6NS60 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Fbxo41Q6NS60 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Fbxo41Q6NS60 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Fbxo41Q6NS60 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Fbxo41Q6NS60 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Fbxo41Q6NS60 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Fbxo41Q6NS60 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
Fbxo41Q6NS60 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Fbxo41Q6NS60 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Fbxo41Q6NS60 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 567.5 ms