Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NipblQ6KCD5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NipblQ6KCD5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NipblQ6KCD5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NipblQ6KCD5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms