Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ggnbp1Q6K1E7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ggnbp1Q6K1E7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ggnbp1Q6K1E7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ggnbp1Q6K1E7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ggnbp1Q6K1E7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ggnbp1Q6K1E7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ggnbp1Q6K1E7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ggnbp1Q6K1E7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ggnbp1Q6K1E7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ggnbp1Q6K1E7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ggnbp1Q6K1E7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ggnbp1Q6K1E7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ggnbp1Q6K1E7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ggnbp1Q6K1E7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ggnbp1Q6K1E7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ggnbp1Q6K1E7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ggnbp1Q6K1E7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ggnbp1Q6K1E7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ggnbp1Q6K1E7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ggnbp1Q6K1E7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ggnbp1Q6K1E7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ggnbp1Q6K1E7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ggnbp1Q6K1E7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ggnbp1Q6K1E7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ggnbp1Q6K1E7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ggnbp1Q6K1E7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ggnbp1Q6K1E7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ggnbp1Q6K1E7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ggnbp1Q6K1E7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ggnbp1Q6K1E7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ggnbp1Q6K1E7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ggnbp1Q6K1E7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ggnbp1Q6K1E7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ggnbp1Q6K1E7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ggnbp1Q6K1E7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ggnbp1Q6K1E7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ggnbp1Q6K1E7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ggnbp1Q6K1E7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ggnbp1Q6K1E7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ggnbp1Q6K1E7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ggnbp1Q6K1E7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ggnbp1Q6K1E7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ggnbp1Q6K1E7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ggnbp1Q6K1E7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ggnbp1Q6K1E7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ggnbp1Q6K1E7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ggnbp1Q6K1E7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ggnbp1Q6K1E7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ggnbp1Q6K1E7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ggnbp1Q6K1E7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ggnbp1Q6K1E7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ggnbp1Q6K1E7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ggnbp1Q6K1E7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ggnbp1Q6K1E7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ggnbp1Q6K1E7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ggnbp1Q6K1E7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ggnbp1Q6K1E7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ggnbp1Q6K1E7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ggnbp1Q6K1E7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ggnbp1Q6K1E7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ggnbp1Q6K1E7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ggnbp1Q6K1E7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ggnbp1Q6K1E7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ggnbp1Q6K1E7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ggnbp1Q6K1E7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ggnbp1Q6K1E7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ggnbp1Q6K1E7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ggnbp1Q6K1E7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ggnbp1Q6K1E7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ggnbp1Q6K1E7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ggnbp1Q6K1E7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ggnbp1Q6K1E7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ggnbp1Q6K1E7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ggnbp1Q6K1E7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ggnbp1Q6K1E7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ggnbp1Q6K1E7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ggnbp1Q6K1E7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ggnbp1Q6K1E7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ggnbp1Q6K1E7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ggnbp1Q6K1E7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ggnbp1Q6K1E7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ggnbp1Q6K1E7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ggnbp1Q6K1E7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ggnbp1Q6K1E7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ggnbp1Q6K1E7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ggnbp1Q6K1E7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ggnbp1Q6K1E7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ggnbp1Q6K1E7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ggnbp1Q6K1E7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ggnbp1Q6K1E7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ggnbp1Q6K1E7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ggnbp1Q6K1E7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ggnbp1Q6K1E7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ggnbp1Q6K1E7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ggnbp1Q6K1E7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ggnbp1Q6K1E7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms