Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ParpbpQ6IRT3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ParpbpQ6IRT3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ParpbpQ6IRT3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ParpbpQ6IRT3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ParpbpQ6IRT3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ParpbpQ6IRT3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ParpbpQ6IRT3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ParpbpQ6IRT3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ParpbpQ6IRT3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ParpbpQ6IRT3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ParpbpQ6IRT3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ParpbpQ6IRT3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ParpbpQ6IRT3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ParpbpQ6IRT3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ParpbpQ6IRT3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ParpbpQ6IRT3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ParpbpQ6IRT3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ParpbpQ6IRT3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ParpbpQ6IRT3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ParpbpQ6IRT3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ParpbpQ6IRT3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ParpbpQ6IRT3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ParpbpQ6IRT3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ParpbpQ6IRT3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ParpbpQ6IRT3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ParpbpQ6IRT3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ParpbpQ6IRT3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ParpbpQ6IRT3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ParpbpQ6IRT3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ParpbpQ6IRT3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ParpbpQ6IRT3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ParpbpQ6IRT3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ParpbpQ6IRT3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ParpbpQ6IRT3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ParpbpQ6IRT3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ParpbpQ6IRT3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ParpbpQ6IRT3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ParpbpQ6IRT3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ParpbpQ6IRT3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ParpbpQ6IRT3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ParpbpQ6IRT3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ParpbpQ6IRT3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ParpbpQ6IRT3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ParpbpQ6IRT3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ParpbpQ6IRT3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ParpbpQ6IRT3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ParpbpQ6IRT3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ParpbpQ6IRT3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ParpbpQ6IRT3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ParpbpQ6IRT3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ParpbpQ6IRT3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ParpbpQ6IRT3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ParpbpQ6IRT3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ParpbpQ6IRT3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ParpbpQ6IRT3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ParpbpQ6IRT3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ParpbpQ6IRT3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ParpbpQ6IRT3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ParpbpQ6IRT3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ParpbpQ6IRT3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ParpbpQ6IRT3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ParpbpQ6IRT3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ParpbpQ6IRT3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ParpbpQ6IRT3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ParpbpQ6IRT3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ParpbpQ6IRT3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ParpbpQ6IRT3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ParpbpQ6IRT3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ParpbpQ6IRT3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ParpbpQ6IRT3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ParpbpQ6IRT3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ParpbpQ6IRT3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ParpbpQ6IRT3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ParpbpQ6IRT3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ParpbpQ6IRT3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ParpbpQ6IRT3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ParpbpQ6IRT3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ParpbpQ6IRT3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ParpbpQ6IRT3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ParpbpQ6IRT3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ParpbpQ6IRT3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ParpbpQ6IRT3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ParpbpQ6IRT3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ParpbpQ6IRT3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ParpbpQ6IRT3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ParpbpQ6IRT3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ParpbpQ6IRT3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ParpbpQ6IRT3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ParpbpQ6IRT3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ParpbpQ6IRT3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ParpbpQ6IRT3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ParpbpQ6IRT3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ParpbpQ6IRT3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ParpbpQ6IRT3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ParpbpQ6IRT3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ParpbpQ6IRT3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ParpbpQ6IRT3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ParpbpQ6IRT3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ParpbpQ6IRT3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms