Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Hecw2Q6I6G8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Hecw2Q6I6G8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Hecw2Q6I6G8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Hecw2Q6I6G8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Hecw2Q6I6G8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Hecw2Q6I6G8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Hecw2Q6I6G8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Hecw2Q6I6G8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Hecw2Q6I6G8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Hecw2Q6I6G8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Hecw2Q6I6G8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Hecw2Q6I6G8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Hecw2Q6I6G8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Hecw2Q6I6G8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Hecw2Q6I6G8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Hecw2Q6I6G8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Hecw2Q6I6G8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Hecw2Q6I6G8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Hecw2Q6I6G8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Hecw2Q6I6G8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Hecw2Q6I6G8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Hecw2Q6I6G8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Hecw2Q6I6G8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Hecw2Q6I6G8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Hecw2Q6I6G8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Hecw2Q6I6G8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Hecw2Q6I6G8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Hecw2Q6I6G8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Hecw2Q6I6G8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Hecw2Q6I6G8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Hecw2Q6I6G8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Hecw2Q6I6G8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Hecw2Q6I6G8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Hecw2Q6I6G8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Hecw2Q6I6G8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Hecw2Q6I6G8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Hecw2Q6I6G8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Hecw2Q6I6G8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Hecw2Q6I6G8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Hecw2Q6I6G8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Hecw2Q6I6G8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Hecw2Q6I6G8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Hecw2Q6I6G8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Hecw2Q6I6G8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Hecw2Q6I6G8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Hecw2Q6I6G8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Hecw2Q6I6G8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Hecw2Q6I6G8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Hecw2Q6I6G8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Hecw2Q6I6G8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Hecw2Q6I6G8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Hecw2Q6I6G8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Hecw2Q6I6G8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Hecw2Q6I6G8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Hecw2Q6I6G8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Hecw2Q6I6G8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Hecw2Q6I6G8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Hecw2Q6I6G8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Hecw2Q6I6G8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Hecw2Q6I6G8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Hecw2Q6I6G8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Hecw2Q6I6G8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Hecw2Q6I6G8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Hecw2Q6I6G8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Hecw2Q6I6G8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Hecw2Q6I6G8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Hecw2Q6I6G8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Hecw2Q6I6G8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Hecw2Q6I6G8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Hecw2Q6I6G8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Hecw2Q6I6G8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Hecw2Q6I6G8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Hecw2Q6I6G8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Hecw2Q6I6G8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Hecw2Q6I6G8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Hecw2Q6I6G8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Hecw2Q6I6G8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Hecw2Q6I6G8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Hecw2Q6I6G8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Hecw2Q6I6G8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Hecw2Q6I6G8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Hecw2Q6I6G8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Hecw2Q6I6G8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Hecw2Q6I6G8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Hecw2Q6I6G8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Hecw2Q6I6G8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Hecw2Q6I6G8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Hecw2Q6I6G8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Hecw2Q6I6G8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Hecw2Q6I6G8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC35■■■■□ 3.19
Hecw2Q6I6G8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
Hecw2Q6I6G8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Hecw2Q6I6G8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Hecw2Q6I6G8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Hecw2Q6I6G8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Hecw2Q6I6G8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Hecw2Q6I6G8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Hecw2Q6I6G8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Hecw2Q6I6G8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms