Protein–RNA interactions for Protein: Q66L44

Cbarp, Voltage-dependent calcium channel beta subunit-associated regulatory protein, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbarpQ66L44 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CbarpQ66L44 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CbarpQ66L44 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CbarpQ66L44 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CbarpQ66L44 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CbarpQ66L44 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CbarpQ66L44 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CbarpQ66L44 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CbarpQ66L44 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CbarpQ66L44 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CbarpQ66L44 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CbarpQ66L44 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CbarpQ66L44 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CbarpQ66L44 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CbarpQ66L44 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CbarpQ66L44 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CbarpQ66L44 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CbarpQ66L44 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CbarpQ66L44 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CbarpQ66L44 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CbarpQ66L44 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CbarpQ66L44 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CbarpQ66L44 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CbarpQ66L44 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CbarpQ66L44 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CbarpQ66L44 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CbarpQ66L44 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CbarpQ66L44 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CbarpQ66L44 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CbarpQ66L44 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CbarpQ66L44 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CbarpQ66L44 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CbarpQ66L44 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CbarpQ66L44 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CbarpQ66L44 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CbarpQ66L44 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CbarpQ66L44 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CbarpQ66L44 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CbarpQ66L44 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CbarpQ66L44 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CbarpQ66L44 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CbarpQ66L44 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CbarpQ66L44 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CbarpQ66L44 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CbarpQ66L44 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CbarpQ66L44 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CbarpQ66L44 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CbarpQ66L44 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CbarpQ66L44 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CbarpQ66L44 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CbarpQ66L44 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CbarpQ66L44 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CbarpQ66L44 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CbarpQ66L44 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CbarpQ66L44 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CbarpQ66L44 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CbarpQ66L44 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CbarpQ66L44 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CbarpQ66L44 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CbarpQ66L44 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CbarpQ66L44 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CbarpQ66L44 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CbarpQ66L44 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CbarpQ66L44 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CbarpQ66L44 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CbarpQ66L44 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CbarpQ66L44 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CbarpQ66L44 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CbarpQ66L44 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CbarpQ66L44 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CbarpQ66L44 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CbarpQ66L44 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CbarpQ66L44 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CbarpQ66L44 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CbarpQ66L44 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CbarpQ66L44 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CbarpQ66L44 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CbarpQ66L44 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CbarpQ66L44 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CbarpQ66L44 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CbarpQ66L44 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CbarpQ66L44 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CbarpQ66L44 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CbarpQ66L44 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CbarpQ66L44 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CbarpQ66L44 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CbarpQ66L44 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CbarpQ66L44 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CbarpQ66L44 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CbarpQ66L44 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CbarpQ66L44 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CbarpQ66L44 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CbarpQ66L44 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CbarpQ66L44 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CbarpQ66L44 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CbarpQ66L44 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CbarpQ66L44 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CbarpQ66L44 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CbarpQ66L44 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CbarpQ66L44 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms