Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
Top2bQ64511 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
Top2bQ64511 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Top2bQ64511 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Top2bQ64511 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Top2bQ64511 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Top2bQ64511 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Top2bQ64511 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
Top2bQ64511 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Top2bQ64511 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
Top2bQ64511 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Top2bQ64511 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Top2bQ64511 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.99
Top2bQ64511 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC39.94■■■■□ 3.99
Top2bQ64511 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
Top2bQ64511 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Top2bQ64511 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
Top2bQ64511 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Top2bQ64511 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Top2bQ64511 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Top2bQ64511 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
Top2bQ64511 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Top2bQ64511 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
Top2bQ64511 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
Top2bQ64511 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Top2bQ64511 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Top2bQ64511 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Top2bQ64511 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
Top2bQ64511 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Top2bQ64511 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Top2bQ64511 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Top2bQ64511 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Top2bQ64511 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC39.82■■■■□ 3.96
Top2bQ64511 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Top2bQ64511 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
Top2bQ64511 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC39.8■■■■□ 3.96
Top2bQ64511 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Top2bQ64511 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
Top2bQ64511 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
Top2bQ64511 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Top2bQ64511 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Top2bQ64511 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
Top2bQ64511 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
Top2bQ64511 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Top2bQ64511 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Top2bQ64511 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Top2bQ64511 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC39.76■■■■□ 3.96
Top2bQ64511 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
Top2bQ64511 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
Top2bQ64511 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
Top2bQ64511 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Top2bQ64511 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Top2bQ64511 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Top2bQ64511 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
Top2bQ64511 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Top2bQ64511 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Top2bQ64511 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
Top2bQ64511 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Top2bQ64511 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Top2bQ64511 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Top2bQ64511 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Top2bQ64511 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC39.68■■■■□ 3.94
Top2bQ64511 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Top2bQ64511 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
Top2bQ64511 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Top2bQ64511 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
Top2bQ64511 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Top2bQ64511 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
Top2bQ64511 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Top2bQ64511 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Top2bQ64511 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Top2bQ64511 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Top2bQ64511 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Top2bQ64511 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC39.63■■■■□ 3.94
Top2bQ64511 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
Top2bQ64511 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Top2bQ64511 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
Top2bQ64511 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Top2bQ64511 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Top2bQ64511 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
Top2bQ64511 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC39.6■■■■□ 3.93
Top2bQ64511 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Top2bQ64511 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Top2bQ64511 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Top2bQ64511 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Top2bQ64511 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
Top2bQ64511 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Top2bQ64511 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
Top2bQ64511 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Top2bQ64511 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Top2bQ64511 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Top2bQ64511 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
Top2bQ64511 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Top2bQ64511 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Top2bQ64511 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Top2bQ64511 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Top2bQ64511 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Top2bQ64511 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
Top2bQ64511 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Top2bQ64511 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms