Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sf1Q64213 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sf1Q64213 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sf1Q64213 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sf1Q64213 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sf1Q64213 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sf1Q64213 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sf1Q64213 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sf1Q64213 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sf1Q64213 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf1Q64213 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf1Q64213 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sf1Q64213 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sf1Q64213 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sf1Q64213 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf1Q64213 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf1Q64213 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf1Q64213 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sf1Q64213 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sf1Q64213 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sf1Q64213 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sf1Q64213 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sf1Q64213 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sf1Q64213 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sf1Q64213 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sf1Q64213 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sf1Q64213 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf1Q64213 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf1Q64213 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf1Q64213 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf1Q64213 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf1Q64213 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf1Q64213 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf1Q64213 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf1Q64213 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sf1Q64213 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Sf1Q64213 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sf1Q64213 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sf1Q64213 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sf1Q64213 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sf1Q64213 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf1Q64213 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf1Q64213 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf1Q64213 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf1Q64213 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sf1Q64213 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf1Q64213 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sf1Q64213 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf1Q64213 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf1Q64213 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf1Q64213 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sf1Q64213 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf1Q64213 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf1Q64213 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sf1Q64213 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf1Q64213 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf1Q64213 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sf1Q64213 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf1Q64213 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf1Q64213 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf1Q64213 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf1Q64213 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf1Q64213 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf1Q64213 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sf1Q64213 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf1Q64213 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf1Q64213 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf1Q64213 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sf1Q64213 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf1Q64213 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sf1Q64213 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf1Q64213 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf1Q64213 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sf1Q64213 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sf1Q64213 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf1Q64213 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf1Q64213 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf1Q64213 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf1Q64213 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sf1Q64213 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf1Q64213 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf1Q64213 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf1Q64213 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf1Q64213 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sf1Q64213 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sf1Q64213 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sf1Q64213 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sf1Q64213 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sf1Q64213 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sf1Q64213 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sf1Q64213 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sf1Q64213 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sf1Q64213 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sf1Q64213 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sf1Q64213 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sf1Q64213 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sf1Q64213 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sf1Q64213 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sf1Q64213 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sf1Q64213 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms