Protein–RNA interactions for Protein: Q62481

Vps72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps72Q62481 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps72Q62481 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps72Q62481 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps72Q62481 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vps72Q62481 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vps72Q62481 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vps72Q62481 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps72Q62481 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps72Q62481 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps72Q62481 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps72Q62481 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps72Q62481 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps72Q62481 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps72Q62481 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps72Q62481 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps72Q62481 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps72Q62481 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps72Q62481 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps72Q62481 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps72Q62481 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps72Q62481 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps72Q62481 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Vps72Q62481 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Vps72Q62481 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps72Q62481 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps72Q62481 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps72Q62481 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps72Q62481 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps72Q62481 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps72Q62481 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps72Q62481 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps72Q62481 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps72Q62481 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps72Q62481 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps72Q62481 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps72Q62481 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps72Q62481 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps72Q62481 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps72Q62481 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps72Q62481 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps72Q62481 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps72Q62481 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps72Q62481 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps72Q62481 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps72Q62481 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps72Q62481 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps72Q62481 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps72Q62481 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps72Q62481 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps72Q62481 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vps72Q62481 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vps72Q62481 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps72Q62481 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps72Q62481 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps72Q62481 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps72Q62481 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps72Q62481 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps72Q62481 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps72Q62481 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps72Q62481 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps72Q62481 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps72Q62481 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps72Q62481 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps72Q62481 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps72Q62481 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps72Q62481 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps72Q62481 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps72Q62481 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps72Q62481 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps72Q62481 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps72Q62481 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps72Q62481 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps72Q62481 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps72Q62481 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps72Q62481 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vps72Q62481 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Vps72Q62481 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps72Q62481 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps72Q62481 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps72Q62481 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps72Q62481 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps72Q62481 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps72Q62481 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps72Q62481 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps72Q62481 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps72Q62481 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps72Q62481 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps72Q62481 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps72Q62481 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps72Q62481 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps72Q62481 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps72Q62481 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps72Q62481 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps72Q62481 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps72Q62481 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Vps72Q62481 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps72Q62481 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps72Q62481 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps72Q62481 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps72Q62481 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms