Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Sall3Q62255 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Sall3Q62255 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Sall3Q62255 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Sall3Q62255 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Sall3Q62255 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Sall3Q62255 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Sall3Q62255 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Sall3Q62255 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Sall3Q62255 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Sall3Q62255 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Sall3Q62255 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Sall3Q62255 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Sall3Q62255 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Sall3Q62255 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Sall3Q62255 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Sall3Q62255 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Sall3Q62255 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Sall3Q62255 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Sall3Q62255 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Sall3Q62255 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Sall3Q62255 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Sall3Q62255 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Sall3Q62255 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Sall3Q62255 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Sall3Q62255 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Sall3Q62255 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Sall3Q62255 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Sall3Q62255 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Sall3Q62255 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Sall3Q62255 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Sall3Q62255 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Sall3Q62255 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Sall3Q62255 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Sall3Q62255 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Sall3Q62255 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Sall3Q62255 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Sall3Q62255 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Sall3Q62255 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Sall3Q62255 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Sall3Q62255 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Sall3Q62255 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Sall3Q62255 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Sall3Q62255 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Sall3Q62255 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Sall3Q62255 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Sall3Q62255 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Sall3Q62255 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Sall3Q62255 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Sall3Q62255 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Sall3Q62255 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Sall3Q62255 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Sall3Q62255 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Sall3Q62255 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Sall3Q62255 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Sall3Q62255 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Sall3Q62255 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC33.32■■■□□ 2.93
Sall3Q62255 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Sall3Q62255 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Sall3Q62255 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Sall3Q62255 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Sall3Q62255 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Sall3Q62255 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Sall3Q62255 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Sall3Q62255 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Sall3Q62255 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Sall3Q62255 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Sall3Q62255 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Sall3Q62255 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Sall3Q62255 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Sall3Q62255 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Sall3Q62255 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Sall3Q62255 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Sall3Q62255 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Sall3Q62255 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Sall3Q62255 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Sall3Q62255 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Sall3Q62255 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Sall3Q62255 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Sall3Q62255 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Sall3Q62255 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Sall3Q62255 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Sall3Q62255 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Sall3Q62255 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Sall3Q62255 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Sall3Q62255 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Sall3Q62255 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Sall3Q62255 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Sall3Q62255 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Sall3Q62255 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Sall3Q62255 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Sall3Q62255 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Sall3Q62255 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Sall3Q62255 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Sall3Q62255 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Sall3Q62255 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Sall3Q62255 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Sall3Q62255 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
Sall3Q62255 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Sall3Q62255 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms