Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SnrpcQ62241 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SnrpcQ62241 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SnrpcQ62241 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SnrpcQ62241 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SnrpcQ62241 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SnrpcQ62241 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SnrpcQ62241 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SnrpcQ62241 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnrpcQ62241 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnrpcQ62241 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnrpcQ62241 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnrpcQ62241 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnrpcQ62241 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnrpcQ62241 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SnrpcQ62241 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SnrpcQ62241 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnrpcQ62241 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnrpcQ62241 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnrpcQ62241 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnrpcQ62241 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpcQ62241 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpcQ62241 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpcQ62241 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpcQ62241 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpcQ62241 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpcQ62241 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpcQ62241 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpcQ62241 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpcQ62241 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpcQ62241 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpcQ62241 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpcQ62241 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpcQ62241 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpcQ62241 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpcQ62241 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpcQ62241 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpcQ62241 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpcQ62241 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpcQ62241 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpcQ62241 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpcQ62241 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpcQ62241 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpcQ62241 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpcQ62241 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpcQ62241 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpcQ62241 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpcQ62241 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpcQ62241 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpcQ62241 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SnrpcQ62241 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms