Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim27Q62158 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim27Q62158 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim27Q62158 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim27Q62158 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim27Q62158 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trim27Q62158 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trim27Q62158 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trim27Q62158 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim27Q62158 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim27Q62158 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim27Q62158 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim27Q62158 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim27Q62158 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim27Q62158 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim27Q62158 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim27Q62158 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim27Q62158 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim27Q62158 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim27Q62158 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim27Q62158 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trim27Q62158 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trim27Q62158 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trim27Q62158 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trim27Q62158 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trim27Q62158 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trim27Q62158 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trim27Q62158 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Trim27Q62158 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trim27Q62158 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trim27Q62158 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Trim27Q62158 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trim27Q62158 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trim27Q62158 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trim27Q62158 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trim27Q62158 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trim27Q62158 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim27Q62158 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim27Q62158 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim27Q62158 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim27Q62158 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim27Q62158 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim27Q62158 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trim27Q62158 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Trim27Q62158 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trim27Q62158 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trim27Q62158 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trim27Q62158 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trim27Q62158 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trim27Q62158 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trim27Q62158 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trim27Q62158 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trim27Q62158 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trim27Q62158 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trim27Q62158 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trim27Q62158 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trim27Q62158 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trim27Q62158 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trim27Q62158 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trim27Q62158 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trim27Q62158 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trim27Q62158 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trim27Q62158 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trim27Q62158 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trim27Q62158 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trim27Q62158 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trim27Q62158 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trim27Q62158 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trim27Q62158 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trim27Q62158 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trim27Q62158 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Trim27Q62158 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trim27Q62158 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trim27Q62158 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trim27Q62158 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trim27Q62158 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trim27Q62158 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trim27Q62158 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trim27Q62158 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim27Q62158 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim27Q62158 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim27Q62158 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim27Q62158 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim27Q62158 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim27Q62158 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim27Q62158 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim27Q62158 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim27Q62158 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim27Q62158 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trim27Q62158 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim27Q62158 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trim27Q62158 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trim27Q62158 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trim27Q62158 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trim27Q62158 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim27Q62158 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim27Q62158 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim27Q62158 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim27Q62158 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim27Q62158 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms