Protein–RNA interactions for Protein: Q61818

Rai1, Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1Q61818 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rai1Q61818 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rai1Q61818 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rai1Q61818 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rai1Q61818 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rai1Q61818 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rai1Q61818 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rai1Q61818 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rai1Q61818 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rai1Q61818 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rai1Q61818 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rai1Q61818 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rai1Q61818 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rai1Q61818 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rai1Q61818 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rai1Q61818 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rai1Q61818 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rai1Q61818 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rai1Q61818 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rai1Q61818 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rai1Q61818 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rai1Q61818 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rai1Q61818 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rai1Q61818 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rai1Q61818 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rai1Q61818 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rai1Q61818 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rai1Q61818 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rai1Q61818 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rai1Q61818 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rai1Q61818 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rai1Q61818 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rai1Q61818 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rai1Q61818 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rai1Q61818 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rai1Q61818 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rai1Q61818 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rai1Q61818 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rai1Q61818 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rai1Q61818 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rai1Q61818 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rai1Q61818 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rai1Q61818 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rai1Q61818 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rai1Q61818 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rai1Q61818 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rai1Q61818 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rai1Q61818 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rai1Q61818 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rai1Q61818 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rai1Q61818 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rai1Q61818 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.02■■□□□ 1.27
Rai1Q61818 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.02■■□□□ 1.27
Rai1Q61818 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rai1Q61818 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rai1Q61818 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rai1Q61818 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rai1Q61818 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rai1Q61818 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rai1Q61818 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rai1Q61818 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rai1Q61818 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rai1Q61818 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rai1Q61818 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rai1Q61818 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rai1Q61818 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rai1Q61818 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rai1Q61818 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rai1Q61818 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rai1Q61818 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rai1Q61818 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rai1Q61818 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rai1Q61818 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rai1Q61818 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rai1Q61818 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rai1Q61818 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rai1Q61818 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rai1Q61818 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rai1Q61818 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rai1Q61818 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rai1Q61818 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rai1Q61818 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rai1Q61818 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rai1Q61818 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rai1Q61818 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rai1Q61818 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rai1Q61818 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rai1Q61818 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rai1Q61818 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rai1Q61818 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rai1Q61818 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rai1Q61818 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rai1Q61818 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rai1Q61818 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rai1Q61818 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rai1Q61818 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rai1Q61818 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rai1Q61818 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rai1Q61818 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rai1Q61818 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
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