Protein–RNA interactions for Protein: Q61468

Msln, Mesothelin, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MslnQ61468 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MslnQ61468 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MslnQ61468 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MslnQ61468 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MslnQ61468 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MslnQ61468 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MslnQ61468 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MslnQ61468 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MslnQ61468 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MslnQ61468 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MslnQ61468 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MslnQ61468 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MslnQ61468 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MslnQ61468 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MslnQ61468 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MslnQ61468 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MslnQ61468 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MslnQ61468 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MslnQ61468 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MslnQ61468 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MslnQ61468 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MslnQ61468 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MslnQ61468 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MslnQ61468 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MslnQ61468 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MslnQ61468 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MslnQ61468 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MslnQ61468 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MslnQ61468 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MslnQ61468 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MslnQ61468 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MslnQ61468 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MslnQ61468 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MslnQ61468 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MslnQ61468 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MslnQ61468 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MslnQ61468 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MslnQ61468 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MslnQ61468 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MslnQ61468 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MslnQ61468 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MslnQ61468 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MslnQ61468 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MslnQ61468 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MslnQ61468 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MslnQ61468 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MslnQ61468 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MslnQ61468 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MslnQ61468 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MslnQ61468 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MslnQ61468 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MslnQ61468 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MslnQ61468 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MslnQ61468 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MslnQ61468 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MslnQ61468 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MslnQ61468 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MslnQ61468 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MslnQ61468 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MslnQ61468 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MslnQ61468 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MslnQ61468 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MslnQ61468 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MslnQ61468 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MslnQ61468 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MslnQ61468 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MslnQ61468 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MslnQ61468 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MslnQ61468 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MslnQ61468 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MslnQ61468 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MslnQ61468 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MslnQ61468 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MslnQ61468 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MslnQ61468 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MslnQ61468 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MslnQ61468 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MslnQ61468 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MslnQ61468 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MslnQ61468 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MslnQ61468 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MslnQ61468 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MslnQ61468 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MslnQ61468 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MslnQ61468 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MslnQ61468 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MslnQ61468 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MslnQ61468 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MslnQ61468 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MslnQ61468 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MslnQ61468 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MslnQ61468 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MslnQ61468 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MslnQ61468 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MslnQ61468 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MslnQ61468 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MslnQ61468 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MslnQ61468 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MslnQ61468 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MslnQ61468 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms