Protein–RNA interactions for Protein: Q61221

Hif1a, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif1aQ61221 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hif1aQ61221 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hif1aQ61221 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hif1aQ61221 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hif1aQ61221 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hif1aQ61221 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hif1aQ61221 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hif1aQ61221 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hif1aQ61221 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hif1aQ61221 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hif1aQ61221 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hif1aQ61221 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hif1aQ61221 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hif1aQ61221 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hif1aQ61221 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hif1aQ61221 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hif1aQ61221 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hif1aQ61221 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hif1aQ61221 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hif1aQ61221 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hif1aQ61221 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hif1aQ61221 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hif1aQ61221 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hif1aQ61221 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Hif1aQ61221 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Hif1aQ61221 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hif1aQ61221 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hif1aQ61221 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hif1aQ61221 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hif1aQ61221 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hif1aQ61221 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hif1aQ61221 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hif1aQ61221 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hif1aQ61221 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hif1aQ61221 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hif1aQ61221 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hif1aQ61221 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hif1aQ61221 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hif1aQ61221 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hif1aQ61221 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Hif1aQ61221 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hif1aQ61221 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hif1aQ61221 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hif1aQ61221 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hif1aQ61221 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hif1aQ61221 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hif1aQ61221 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hif1aQ61221 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hif1aQ61221 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hif1aQ61221 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hif1aQ61221 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hif1aQ61221 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hif1aQ61221 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hif1aQ61221 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hif1aQ61221 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hif1aQ61221 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hif1aQ61221 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hif1aQ61221 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hif1aQ61221 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hif1aQ61221 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hif1aQ61221 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hif1aQ61221 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hif1aQ61221 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hif1aQ61221 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hif1aQ61221 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hif1aQ61221 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hif1aQ61221 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hif1aQ61221 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hif1aQ61221 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hif1aQ61221 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hif1aQ61221 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hif1aQ61221 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hif1aQ61221 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hif1aQ61221 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hif1aQ61221 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hif1aQ61221 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hif1aQ61221 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hif1aQ61221 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hif1aQ61221 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hif1aQ61221 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hif1aQ61221 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hif1aQ61221 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hif1aQ61221 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hif1aQ61221 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hif1aQ61221 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hif1aQ61221 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hif1aQ61221 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hif1aQ61221 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hif1aQ61221 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hif1aQ61221 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hif1aQ61221 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hif1aQ61221 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hif1aQ61221 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hif1aQ61221 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hif1aQ61221 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hif1aQ61221 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Hif1aQ61221 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hif1aQ61221 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hif1aQ61221 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hif1aQ61221 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms