Protein–RNA interactions for Protein: Q61116

Znf235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf235Q61116 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Znf235Q61116 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Znf235Q61116 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Znf235Q61116 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Znf235Q61116 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Znf235Q61116 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Znf235Q61116 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Znf235Q61116 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Znf235Q61116 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Znf235Q61116 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Znf235Q61116 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Znf235Q61116 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Znf235Q61116 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Znf235Q61116 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Znf235Q61116 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf235Q61116 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf235Q61116 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Znf235Q61116 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf235Q61116 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf235Q61116 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Znf235Q61116 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Znf235Q61116 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Znf235Q61116 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Znf235Q61116 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Znf235Q61116 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Znf235Q61116 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Znf235Q61116 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Znf235Q61116 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Znf235Q61116 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Znf235Q61116 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Znf235Q61116 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Znf235Q61116 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Znf235Q61116 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Znf235Q61116 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Znf235Q61116 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Znf235Q61116 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Znf235Q61116 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Znf235Q61116 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Znf235Q61116 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Znf235Q61116 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Znf235Q61116 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Znf235Q61116 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Znf235Q61116 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Znf235Q61116 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf235Q61116 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf235Q61116 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Znf235Q61116 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf235Q61116 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf235Q61116 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Znf235Q61116 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Znf235Q61116 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Znf235Q61116 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Znf235Q61116 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Znf235Q61116 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Znf235Q61116 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Znf235Q61116 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Znf235Q61116 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Znf235Q61116 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Znf235Q61116 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Znf235Q61116 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Znf235Q61116 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Znf235Q61116 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Znf235Q61116 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Znf235Q61116 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Znf235Q61116 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Znf235Q61116 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Znf235Q61116 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf235Q61116 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf235Q61116 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf235Q61116 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf235Q61116 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf235Q61116 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf235Q61116 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf235Q61116 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf235Q61116 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf235Q61116 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf235Q61116 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf235Q61116 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Znf235Q61116 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Znf235Q61116 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf235Q61116 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf235Q61116 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf235Q61116 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf235Q61116 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf235Q61116 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf235Q61116 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf235Q61116 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf235Q61116 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf235Q61116 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf235Q61116 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf235Q61116 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Znf235Q61116 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf235Q61116 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf235Q61116 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf235Q61116 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf235Q61116 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf235Q61116 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf235Q61116 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf235Q61116 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Znf235Q61116 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms