Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncor1Q60974 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncor1Q60974 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ncor1Q60974 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ncor1Q60974 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ncor1Q60974 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncor1Q60974 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncor1Q60974 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ncor1Q60974 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncor1Q60974 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncor1Q60974 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ncor1Q60974 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ncor1Q60974 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ncor1Q60974 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ncor1Q60974 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ncor1Q60974 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ncor1Q60974 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ncor1Q60974 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ncor1Q60974 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ncor1Q60974 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ncor1Q60974 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ncor1Q60974 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ncor1Q60974 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ncor1Q60974 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ncor1Q60974 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
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Ncor1Q60974 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ncor1Q60974 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ncor1Q60974 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ncor1Q60974 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ncor1Q60974 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
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Ncor1Q60974 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ncor1Q60974 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ncor1Q60974 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ncor1Q60974 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncor1Q60974 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncor1Q60974 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncor1Q60974 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncor1Q60974 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncor1Q60974 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncor1Q60974 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncor1Q60974 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncor1Q60974 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncor1Q60974 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncor1Q60974 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncor1Q60974 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncor1Q60974 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncor1Q60974 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ncor1Q60974 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ncor1Q60974 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ncor1Q60974 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
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Ncor1Q60974 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
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Ncor1Q60974 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncor1Q60974 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncor1Q60974 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncor1Q60974 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncor1Q60974 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ncor1Q60974 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ncor1Q60974 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ncor1Q60974 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ncor1Q60974 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ncor1Q60974 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ncor1Q60974 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ncor1Q60974 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ncor1Q60974 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ncor1Q60974 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ncor1Q60974 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ncor1Q60974 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ncor1Q60974 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ncor1Q60974 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ncor1Q60974 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ncor1Q60974 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ncor1Q60974 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ncor1Q60974 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ncor1Q60974 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncor1Q60974 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
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