Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctf1Q60753 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctf1Q60753 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ctf1Q60753 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctf1Q60753 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctf1Q60753 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ctf1Q60753 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ctf1Q60753 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctf1Q60753 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ctf1Q60753 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctf1Q60753 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctf1Q60753 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctf1Q60753 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctf1Q60753 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctf1Q60753 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctf1Q60753 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctf1Q60753 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctf1Q60753 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctf1Q60753 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctf1Q60753 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctf1Q60753 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctf1Q60753 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctf1Q60753 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctf1Q60753 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctf1Q60753 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctf1Q60753 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctf1Q60753 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctf1Q60753 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctf1Q60753 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ctf1Q60753 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctf1Q60753 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctf1Q60753 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctf1Q60753 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctf1Q60753 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctf1Q60753 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctf1Q60753 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctf1Q60753 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctf1Q60753 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctf1Q60753 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctf1Q60753 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctf1Q60753 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctf1Q60753 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctf1Q60753 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctf1Q60753 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctf1Q60753 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctf1Q60753 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctf1Q60753 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctf1Q60753 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctf1Q60753 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctf1Q60753 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ctf1Q60753 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctf1Q60753 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctf1Q60753 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ctf1Q60753 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctf1Q60753 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctf1Q60753 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctf1Q60753 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctf1Q60753 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ctf1Q60753 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctf1Q60753 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctf1Q60753 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctf1Q60753 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctf1Q60753 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctf1Q60753 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctf1Q60753 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ctf1Q60753 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctf1Q60753 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ctf1Q60753 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctf1Q60753 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctf1Q60753 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctf1Q60753 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctf1Q60753 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctf1Q60753 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ctf1Q60753 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctf1Q60753 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctf1Q60753 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctf1Q60753 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ctf1Q60753 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctf1Q60753 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctf1Q60753 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctf1Q60753 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctf1Q60753 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctf1Q60753 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctf1Q60753 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctf1Q60753 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctf1Q60753 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctf1Q60753 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctf1Q60753 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctf1Q60753 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ctf1Q60753 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ctf1Q60753 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctf1Q60753 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctf1Q60753 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctf1Q60753 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ctf1Q60753 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctf1Q60753 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctf1Q60753 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctf1Q60753 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctf1Q60753 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctf1Q60753 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms